RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472420.5

LRPPRC-208, Transcript of leucine rich pentatricopeptide repeat containing, human

TSL 2

Gene LRPPRC, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRPPRC-208	ENST00000472420	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	PHF21A	Q96BD5	680 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	TIGD1	Q96MW7	591 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	SFXN2	Q96NB2	322 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	PANX2	Q96RD6	677 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	HBEGF	Q99075	208 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	GPA33	Q99795	319 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	STK33	Q9BYT3	514 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	PARVA	Q9NVD7	372 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LRPPRC-208	ENST00000472420	HERC1	Q15751	4861 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	BICDL2	A1A5D9	508 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420		F8W8V4	182 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	NRDC	O43847	1150 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	CLPX	O76031	633 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	SEC14L2	O76054	403 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	CRTAM	O95727	393 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	IFNA16	P05015	189 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	FCGR2A	P12318	317 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	HRH2	P25021	359 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	MSH2	P43246	934 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	NDUFA8	P51970	172 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	CTBP2	P56545	445 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC13A2	Q13183	592 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	IPMK	Q8NFU5	416 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	DDB2	Q92466	427 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	INPP5K	Q9BT40	448 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	PINK1	Q9BXM7	581 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	XPR1	Q9UBH6	696 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	MUC4	Q99102	2169 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420		A0A0G2JMP0	313 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420		A0A0X1KG70	313 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420		H7C0S8	307 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420		J3QLI3	93 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	CEP104	O60308	925 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	CDH16	O75309	829 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	NDUFA7	O95182	113 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	TF	P02787	698 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	DAO	P14920	347 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	IFNGR1	P15260	489 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	UCHL3	P15374	230 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	PPP1R2	P41236	205 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	CASP3	P42574	277 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	CCZ1B	P86790	482 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	SPOCK1	Q08629	439 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	PNOC	Q13519	176 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	RIN1	Q13671	783 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	DPYSL3	Q14195	570 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	PON3	Q15166	354 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	PPA1	Q15181	289 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	TMED2	Q15363	201 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	TEX44	Q53QW1	395 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	SSX8	Q7RTT4	187 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	CA13	Q8N1Q1	262 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	RDH11	Q8TC12	318 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF721	Q8TF20	911 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LRPPRC-208	ENST00000472420	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41

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