RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465309.6

LMO7-208, Transcript of LIM domain 7, humanhuman

TSL 3

Gene LMO7, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7-208ENST00000465309 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 CMTM6Q9NX76 183 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 AP4S1Q9Y587 144 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 A0A1W2PP18 115 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 A0A1W2PPV9 198 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 NME4O00746 187 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 TNFRSF10CO14798 259 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 ZNHIT1O43257 154 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 PRAMEF2O60811 474 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 SCRG1O75711 98 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 WISP2O76076 250 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 KLHL18O94889 574 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 TNFAIP8O95379 198 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 ETHE1O95571 254 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 KRT6AP02538 564 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 KRT6BP04259 564 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 GPIP06744 558 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 ARAFP10398 606 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 UMPSP11172 480 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 SLC2A4P14672 509 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 TYRP1P17643 537 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 AMD1P17707 334 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 EGR1P18146 543 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 JAK1P23458 1154 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 SLC6A2P23975 617 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 TACR1P25103 407 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 CFPP27918 469 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 HTR3AP46098 478 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 KRT6CP48668 564 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 AQP4P55087 323 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 TBPL1P62380 186 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 ZNF33BQ06732 778 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 TFF3Q07654 80 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 PTGR1Q14914 329 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 PDK3Q15120 406 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 CYP2A13Q16696 494 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 SFT2D3Q587I9 215 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 MTX3Q5HYI7 312 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 FRG2Q64ET8 278 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 DPP10Q8N608 796 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 RNF148Q8N7C7 305 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 ATL1Q8WXF7 558 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 NEIL2Q969S2 332 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 LRRC58Q96CX6 371 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 FOPNLQ96NB1 174 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 AGAP4Q96P64 663 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 IL17FQ96PD4 163 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 FRG2BQ96QU4 278 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 TSC22D3Q99576 134 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 SH3GL1Q99961 368 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 HAUS8Q9BT25 410 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 NLNQ9BYT8 704 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 RMI1Q9H9A7 625 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 C1orf109Q9NX04 203 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO7-208ENST00000465309 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms