RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 ITPAQ9BY32 194 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CENPHQ9H3R5 247 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR41Q9HAD4 459 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TMBIM4Q9HC24 238 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 HPF1Q9NWY4 346 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 UTS2RQ9UKP6 389 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 A1L4Q6 167 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C17orf51A8MQB3 221 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC28A1O00337 649 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CDK2AP1O14519 115 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAM10O14672 748 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRTM2O43300 516 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ASNA1O43681 348 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC22BO75396 215 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6AP2O75787 350 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PDE9AO76083 593 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 UNC5CO95185 931 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP1B1P05026 303 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CELA3AP09093 270 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO45P0C2W1 286 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 COX7A2P14406 83 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 DRD2P14416 443 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SDC1P18827 310 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CNR1P21554 472 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 BGNP21810 368 aa6.45□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 CDSNQ15517 529 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CHI3L2Q15782 390 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NNATQ16517 81 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C3AR1Q16581 482 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NTRK2Q16620 822 aa6.45□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 XKR7Q5GH72 579 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.45□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 LRIG3Q6UXM1 1119 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.45□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 CNPY4Q8N129 248 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OR7G2Q8NG99 324 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC26Q8NHZ8 85 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TLCD1Q96CP7 247 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C5orf34Q96MH7 638 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 DOCK7Q96N67 2140 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TSSK3Q96PN8 268 aa6.45□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 NODALQ96S42 347 aa6.45□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf109Q9NX04 203 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MID2Q9UJV3 735 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6C76A6NM76 312 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM166BA8MTA8 275 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BQF6 201 aa6.44□□□□□ -1.38
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