RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC2A12Q8TD20 617 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXL20Q96IG2 436 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 AGAP4Q96P64 663 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 VCX3BQ9H321 246 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 VCX3AQ9NNX9 186 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 COPS7AQ9UBW8 275 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PDPK1O15530 556 aa9.86□□□□□ -0.83
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RABGEF1-205ENST00000450873 ALPPP05187 535 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PRSS53Q2L4Q9 553 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CRB2Q5IJ48 1285 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TCTN3Q6NUS6 607 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 H3F3CQ6NXT2 135 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 OR7G1Q8NGA0 311 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 OR7A2PQ8NGA2 310 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 RFWD2Q8NHY2 731 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF675Q8TD23 568 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF721Q8TF20 911 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 COQ8BQ96D53 544 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ERP27Q96DN0 273 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 EBF4Q9BQW3 602 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CNPPD1Q9BV87 410 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DEFB126Q9BYW3 111 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TEKT2Q9UIF3 430 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MED13Q9UHV7 2174 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CLEC18AA5D8T8 446 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SLITRK5O94991 958 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV3-11P04433 115 aa9.85□□□□□ -0.83
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RABGEF1-205ENST00000450873 DUSP2Q05923 314 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 FUT7Q11130 342 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF385BQ569K4 471 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CLEC18BQ6UXF7 455 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 HSDL2Q6YN16 418 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.85□□□□□ -0.83
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RABGEF1-205ENST00000450873 CLEC18CQ8NCF0 446 aa9.85□□□□□ -0.83
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RABGEF1-205ENST00000450873 LMF1Q96S06 567 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBTB18Q99592 522 aa9.85□□□□□ -0.83
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RABGEF1-205ENST00000450873 NUDT9Q9BW91 350 aa9.85□□□□□ -0.83
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RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MAT2BQ9NZL9 334 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CROCCQ5TZA2 2017 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0G2JND7 137 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD28O15084 1053 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
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RABGEF1-205ENST00000450873 LAMP1P11279 417 aa9.85□□□□□ -0.83
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RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF628Q5EBL2 1059 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM198Q66K66 360 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM111BQ6SJ93 734 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ISLR2Q6UXK2 745 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.85□□□□□ -0.83
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RABGEF1-205ENST00000450873 OR9A2Q8NGT5 310 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SUN3Q8TAQ9 357 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 C17orf50Q8WW18 174 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAJC9Q8WXX5 260 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TESCQ96BS2 214 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CTHRC1Q96CG8 243 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF354BQ96LW1 612 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 RILPQ96NA2 401 aa9.85□□□□□ -0.83
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