RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 HIVEP1P15822 2718 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ACOT7O00154 380 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC28A1O00337 649 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 RGS14O43566 566 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 GLSO94925 669 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 CHEK2O96017 543 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 CHRNGP07510 517 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 NEFHP12036 1026 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 DDCP20711 480 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 GPX3P22352 226 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SOX18P35713 384 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SERPINB5P36952 375 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 NRG3P56975 720 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 PPIAP62937 165 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 HSF1Q00613 529 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 PLGLB1Q02325 96 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 LTB4RQ15722 352 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 C3AR1Q16581 482 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 NTRK2Q16620 822 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC22A10Q63ZE4 541 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 KANK2Q63ZY3 851 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 RGS9BPQ6ZS82 235 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM47EQ6ZV65 393 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 FBXW8Q8N3Y1 598 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM13CQ8NE31 585 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 OR10G3Q8NGC4 313 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 TTTY12Q9BZ98 90 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 TUBB1Q9H4B7 451 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 CNIH4Q9P003 139 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 BCAP29Q9UHQ4 241 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 TINAGQ9UJW2 476 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ENTPD4Q9Y227 616 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 FIS1Q9Y3D6 152 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 NINQ8N4C6 2090 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 PCNX1Q96RV3 2341 aa13.02□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 DCHS2Q6V1P9 2916 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM166BA8MTA8 275 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 CAPN14A8MX76 684 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 CCL21O00585 134 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 ZG16O60844 167 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 CBX7O95931 251 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 BPGMP07738 259 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 FGF4P08620 206 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 ABOP16442 354 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 PCSK2P16519 638 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 ETV4P43268 484 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 TMED10P49755 219 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 C2orf80Q0P641 193 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 FOXO1Q12778 655 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 DUSP8Q13202 625 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 KIAA0040Q15053 153 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 RPS6KA2Q15349 733 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 CEBPEQ15744 281 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF628Q5EBL2 1059 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM71E1Q6IPT2 247 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 NOXRED1Q6NXP6 359 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 MTFR2Q6P444 385 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 IKBIPQ70UQ0 350 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 FGD2Q7Z6J4 655 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC22A16Q86VW1 577 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC116Q8IYX3 515 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 OR52R1Q8NGF1 315 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 OR52N2Q8NGI0 321 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 OR9A2Q8NGT5 310 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 OR2T11Q8NH01 316 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 CDC26Q8NHZ8 85 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 ERP27Q96DN0 273 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 ITPAQ9BY32 194 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 IL1RL2Q9HB29 575 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 LRTM1Q9HBL6 345 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 MIEF1Q9NQG6 463 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 C1orf109Q9NX04 203 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 PRODH2Q9UF12 536 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 DTX4Q9Y2E6 619 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 TRAF6Q9Y4K3 522 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 NF1P21359 2839 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1B0GTH9 108 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 CTIFO43310 598 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 SEC22BO75396 215 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-205ENST00000444916 PIGAP37287 484 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms