RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 CYB561D2O14569 222 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PRKYO43930 277 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 OR7C2O60412 319 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PIAS1O75925 651 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 OR2J2O76002 312 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 JCHAINP01591 159 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FAM86B2P0C5J1 330 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CRHBPP24387 322 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MSX1P28360 303 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 HAGHQ16775 308 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 STRADAQ7RTN6 431 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 IP6K1Q92551 441 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 KCNA7Q96RP8 456 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 LMF1Q96S06 567 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 IGSF6O95976 241 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CSF1P09603 554 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SLC2A4P14672 509 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 TNFSF4P23510 183 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 BMP8BP34820 402 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 BTG1P62324 171 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 NRMQ8IXM6 262 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 STACQ99469 402 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 A6NLC8 198 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 TTLL4Q14679 1199 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CEBPEQ15744 281 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SUSD1Q6UWL2 747 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 DPPA4Q7L190 304 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 RNF141Q8WVD5 230 aa5.34□□□□□ -1.55
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