RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 AP3D1O14617 1153 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 FUCA1P04066 466 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SOX3P41225 446 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC13A2Q13183 592 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CFHR5Q9BXR6 569 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TBC1D17Q9HA65 648 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 HMG20AQ9NP66 347 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SESN1Q9Y6P5 492 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SPINT1O43278 529 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ICMTO60725 284 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SNX4O95219 450 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TSPAN19P0C672 248 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SAGP10523 405 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 HSD3B1P14060 373 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 DDCP20711 480 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 IL32P24001 234 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 HSD3B2P26439 372 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNJ10P78508 379 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 RHAGQ02094 409 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 FGL2Q14314 439 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 MINDY4Q4G0A6 757 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 AGBL4Q5VU57 503 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ABHD11Q8NFV4 315 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 P2RX2Q9UBL9 471 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 VCANP13611 3396 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 UGDHO60701 494 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 EML2O95834 649 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ANXA8P13928 327 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 C5AR1P21730 350 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CENPAP49450 140 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CRISP3P54108 245 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CSNK1G2P78368 415 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 IQCCQ4KMZ1 466 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 UBE2UQ5VVX9 321 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF44Q7L0R7 432 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 LHFPL3Q86UP9 236 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 GALNT12Q8IXK2 581 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 OR5T3Q8NGG3 340 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 OR1E3Q8WZA6 343 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 C3orf14Q9HBI5 128 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 PLCL2Q9UPR0 1127 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 NPC1O15118 1278 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CLPXO76031 633 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 RUNX1T1Q06455 604 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 MPEG1Q2M385 716 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM196Q5HYL7 178 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CDKL4Q5MAI5 379 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM71E1Q6IPT2 247 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 NUP43Q8NFH3 380 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 LGALS12Q96DT0 336 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A0G2JPF8 293 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 LAMP2P13473 410 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TAS2R38P59533 333 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 GINS1Q14691 196 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SPATS1Q496A3 300 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ENTHD1Q8IYW4 607 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ZG16BQ96DA0 208 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CDADC1Q9BWV3 514 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 UCK2Q9BZX2 261 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 GLIPR2Q9H4G4 154 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHL1Q9NR64 748 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CORINQ9Y5Q5 1042 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SCN2BO60939 215 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SOX30O94993 753 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 MPIP34949 423 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SHC2P98077 582 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 RPE65Q16518 533 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 LIPKQ5VXJ0 399 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 USP30Q70CQ3 517 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 FAR1Q8WVX9 515 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 MAGIXQ9H6Y5 334 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 FANCFQ9NPI8 374 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 QPCTLQ9NXS2 382 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 HCN3Q9P1Z3 774 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHL42Q9P2K6 505 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ACSL5Q9ULC5 683 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10H1Q9Y4A9 318 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNE3Q9Y6H6 103 aa12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms