RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
USP40-202ENST00000409945 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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USP40-202ENST00000409945 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6□□□□□ -1.45
USP40-202ENST00000409945 LIPCP11150 499 aa6□□□□□ -1.45
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USP40-202ENST00000409945 FOXM1Q08050 763 aa6□□□□□ -1.45
USP40-202ENST00000409945 GPR18Q14330 331 aa6□□□□□ -1.45
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USP40-202ENST00000409945 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
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USP40-202ENST00000409945 MAGEC3Q8TD91 643 aa6□□□□□ -1.45
USP40-202ENST00000409945 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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USP40-202ENST00000409945 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
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USP40-202ENST00000409945 PRSS22Q9GZN4 317 aa6□□□□□ -1.45
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USP40-202ENST00000409945 ASCL3Q9NQ33 180 aa6□□□□□ -1.45
USP40-202ENST00000409945 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
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USP40-202ENST00000409945 USP24Q9UPU5 2620 aa6□□□□□ -1.45
USP40-202ENST00000409945 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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USP40-202ENST00000409945 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
USP40-202ENST00000409945 EML2O95834 649 aa5.99□□□□□ -1.45
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USP40-202ENST00000409945 DR1Q01658 176 aa5.99□□□□□ -1.45
USP40-202ENST00000409945 CUL1Q13616 776 aa5.99□□□□□ -1.45
USP40-202ENST00000409945 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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