RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 RHBDD1Q8TEB9 315 aa27.56■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 TMBIM1Q969X1 311 aa27.56■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 ZNF570Q96NI8 536 aa27.56■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 OR6C1Q96RD1 312 aa27.56■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa27.56■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa27.56■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 NTN4Q9HB63 628 aa27.56■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa27.56■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 A0A1B0GX78 115 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 ASNA1O43681 348 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 JRKO75564 520 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 SOX18P35713 384 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 HSD17B7P56937 341 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 KCNJ10P78508 379 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 GNA13Q14344 377 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 IFI44LQ53G44 452 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 CMPK2Q5EBM0 449 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 ATAD3BQ5T9A4 648 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 SMYD1Q8NB12 490 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 ZNF607Q96SK3 696 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 ZNF304Q9HCX3 659 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 C11orf16Q9NQ32 467 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 SRPK3Q9UPE1 567 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 KCNE3Q9Y6H6 103 aa27.55■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 LAMA1P25391 3075 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 TMEM229AB2RXF0 380 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 D6RAR5 112 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 FLRT2O43155 660 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 PLOD3O60568 738 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 CT62P0C5K7 136 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 MAOAP21397 527 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 MAN2A2P49641 1150 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 CRISP3P54108 245 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 VLDLRP98155 873 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 MGAT2Q10469 447 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 GPAT3Q53EU6 434 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 ARHGAP40Q5TG30 622 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 PPP4R4Q6NUP7 873 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 CDC73Q6P1J9 531 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 BBS10Q8TAM1 723 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 SLC9A6Q92581 669 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 DGAT2Q96PD7 388 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 ABCG2Q9UNQ0 655 aa27.54■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 PRSS23O95084 383 aa27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 MAPK10P53779 464 aa27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 FUT5Q11128 374 aa27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 DSG2Q14126 1118 aa27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 GALNT12Q8IXK2 581 aa27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 PACRGLQ8N7B6 248 aa27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 RNF31Q96EP0 1072 aa27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 BTBD9Q96Q07 612 aa27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 FTSJ1Q9UET6 329 aa27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 RARRES3Q9UL19 164 aa27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 LRCH1Q9Y2L9 728 aa27.53■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 OR2W5A6NFC9 320 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 IFI6P09912 130 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 HSPA13P48723 471 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 MFSD4BQ5TF39 518 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 OLIG3Q7RTU3 272 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 C16orf62Q7Z3J2 963 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 SLITRK4Q8IW52 837 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 VWA5B2Q8N398 1253 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 COL21A1Q96P44 957 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 DUXAA6NLW8 204 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 ACOX3O15254 700 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 E2F6O75461 281 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 RPSAP08865 295 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 TNFRSF1BP20333 461 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 NUBP1P53384 320 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 DBX2Q6ZNG2 339 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 KRT73Q86Y46 540 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 ARMC8Q8IUR7 673 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 RIT1Q92963 219 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 SLC35A4Q96G79 324 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 OR1F2PQ96R84 312 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 RUBCNLQ9H714 662 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 CXorf21Q9HAI6 301 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 C8orf4Q9NR00 106 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 LANCL2Q9NS86 450 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 EXD2Q9NVH0 621 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 LIPT1Q9Y234 373 aa27.52■■■□□ 2
LMO2-202ENST00000395833 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
LMO2-202ENST00000395833 DIRAS1O95057 198 aa27.51■■□□□ 1.99
LMO2-202ENST00000395833 AGR2O95994 175 aa27.51■■□□□ 1.99
LMO2-202ENST00000395833 CHRM4P08173 479 aa27.51■■□□□ 1.99
LMO2-202ENST00000395833 UQCRBP14927 111 aa27.51■■□□□ 1.99
LMO2-202ENST00000395833 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
LMO2-202ENST00000395833 CYP27C1Q4G0S4 372 aa27.51■■□□□ 1.99
LMO2-202ENST00000395833 OR2T5Q6IEZ7 315 aa27.51■■□□□ 1.99
LMO2-202ENST00000395833 SLC16A11Q8NCK7 471 aa27.51■■□□□ 1.99
LMO2-202ENST00000395833 OR2T29Q8NH02 315 aa27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms