RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 UQCRC2P22695 453 aa26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM64Q6YI46 380 aa26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 NUP43Q8NFH3 380 aa26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 SFXN5Q8TD22 340 aa26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 NACC2Q96BF6 587 aa26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 ART5Q96L15 291 aa26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 IMMP1LQ96LU5 166 aa26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 TUBB6Q9BUF5 446 aa26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 TRIM8Q9BZR9 551 aa26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 EQTNQ9NQ60 294 aa26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 A0A087WV62 115 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 ERN1O75460 977 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 BTBD16Q32M84 506 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 KIF2BQ8N4N8 673 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 TRIML2Q8N7C3 387 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 EFCAB1Q9HAE3 211 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 C3orf14Q9HBI5 128 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 COPS7AQ9UBW8 275 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 HPP00738 406 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 ZCCHC18P0CG32 403 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 GPR143P51810 404 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 CASP9P55211 416 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 PRR5P85299 388 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 CDC20Q12834 499 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF615Q8N8J6 731 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 APCDD1LQ8NCL9 501 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 OR1N1Q8NGS0 311 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 CGREF1Q99674 301 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 OR10A5Q9H207 317 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 RRP8O43159 456 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 CALB2P22676 271 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 SLC37A1P57057 533 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 RPS26P62854 115 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 ART3Q13508 389 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 RNF111Q6ZNA4 994 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 OR56A1Q8NGH5 318 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 FBXO30Q8TB52 745 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 ZFP90Q8TF47 636 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 LRRC58Q96CX6 371 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 IP6K3Q96PC2 410 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 MS4A4EQ96PG1 132 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 PHF12Q96QT6 1004 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 NTMQ9P121 344 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 DTX4Q9Y2E6 619 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 EBAG9O00559 213 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 PRAMEF2O60811 474 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 PSMG1O95456 288 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 IFI6P09912 130 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 SAXO2Q658L1 398 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 OR7G1Q8NGA0 311 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 GIMAP5Q96F15 307 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 VMP1Q96GC9 406 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 VPS50Q96JG6 964 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 EPS8L2Q9H6S3 715 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 GID8Q9NWU2 228 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 COQ9O75208 318 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 EMDP50402 254 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 MXRA7P84157 204 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 Q0VFX4 171 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 SELPLGQ14242 412 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 EXT1Q16394 746 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 PLAG1Q6DJT9 500 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 C6orf120Q7Z4R8 191 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 C9orf40Q8IXQ3 194 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 DNAJB8Q8NHS0 232 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 C16orf52Q8NHV5 167 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 MOAP1Q96BY2 351 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 ROPN1LQ96C74 230 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 SLC35G5Q96KT7 338 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 YIPF4Q9BSR8 244 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 SEMA4CQ9C0C4 833 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 IKZF5Q9H5V7 419 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 TPT1P8Q9HAU6 139 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 GPATCH2Q9NW75 528 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 SSUH2Q9Y2M2 353 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-202ENST00000393028 TAF4O00268 1085 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 MTPNP58546 118 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 TLE3Q04726 772 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 RINLQ6ZS11 566 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 RNF130Q86XS8 419 aa26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms