RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPS8L2Q9H6S3 715 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPATCH2Q9NW75 528 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAT2BQ9NZL9 334 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 PADI1Q9ULC6 663 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 AP4S1Q9Y587 144 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 GMEB1Q9Y692 573 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 SDK2Q58EX2 2172 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 IDSB3KWA1 339 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 HEXBP07686 556 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPIBP23284 216 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 MGAT2Q10469 447 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 TP53BP2Q13625 1128 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAAH2Q6GMR7 532 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM64Q6YI46 380 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 PQLC1Q8N2U9 271 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLPP5Q8NEB5 264 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 CANT1Q8WVQ1 401 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 FIG4Q92562 907 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 NSMCE2Q96MF7 247 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC46A1Q96NT5 459 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 CXorf21Q9HAI6 301 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCRBV5S2A0A599 114 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 C9J4A7 227 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCNYL3P0C7X3 344 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 VHLP40337 213 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRKAG1P54619 331 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 BIKQ13323 160 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM69BQ5VUD6 431 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 SAXO2Q658L1 398 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 C6orf120Q7Z4R8 191 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF130Q86XS8 419 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 RIT1Q92963 219 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 CORO2BQ9UQ03 480 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 DHRS12A0PJE2 317 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 UPK1AO00322 258 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLOD2O00469 737 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 EMC8O43402 210 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC5A2P31639 672 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 MVDP53602 400 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 NCF4Q15080 339 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYP51A1Q16850 503 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 COX20Q5RI15 118 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF675Q8TD23 568 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEURL3Q96EH8 262 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR54Q9H977 334 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 C3orf14Q9HBI5 128 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRT75O95678 551 aa25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 SDHBP21912 280 aa25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 POLE2P56282 527 aa25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 RGNQ15493 299 aa25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 LANCL3Q6ZV70 420 aa25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 GALNT12Q8IXK2 581 aa25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUP43Q8NFH3 380 aa25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 SFXN5Q8TD22 340 aa25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 CTHRC1Q96CG8 243 aa25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 GORASP2Q9H8Y8 452 aa25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 C3orf18Q9UK00 162 aa25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 A8MUA0 341 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 CXCR6O00574 342 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNNI3P19429 210 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS26P62854 115 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRR5P85299 388 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 FHL5Q5TD97 284 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2L13Q8N349 312 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 CRB3Q9BUF7 120 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 B3GNT4Q9C0J1 378 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTGFRNQ9P2B2 879 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 AURKCQ9UQB9 309 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 HRKO00198 91 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 NME6O75414 186 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 CRATP43155 626 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 EMP2P54851 167 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAP4K2Q12851 820 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAP7Q14244 749 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADGRG5Q8IZF4 528 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 LILRA2Q8N149 483 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 VWA5B2Q8N398 1253 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR52N2Q8NGI0 321 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 MOAP1Q96BY2 351 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 MESP1Q9BRJ9 268 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 EFHD1Q9BUP0 239 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALOX12BO75342 701 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPIP06744 558 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 PGDP52209 483 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 VAC14Q08AM6 782 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms