RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 PIRTP0C851 137 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MSL3P1P0C860 447 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PEPDP12955 493 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 AMD1P17707 334 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CR2P20023 1033 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GALP22466 123 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TALDO1P37837 337 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ETV3P41162 512 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CDKN2CP42773 168 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CRYBB2P43320 205 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KIR2DL3P43628 341 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GSTM5P46439 218 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC11A2P49281 568 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NUDT6P53370 316 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ATP12AP54707 1039 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 AP1S2P56377 157 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RGS1Q08116 209 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GPM6BQ13491 265 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF7Q14155 803 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SGO1Q5FBB7 561 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TOR2AQ5JU69 321 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CPTPQ5TA50 214 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FRG2Q64ET8 278 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FRMPD2BQ6IN97 320 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD46Q86W74 232 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC34A3Q8N130 599 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NATD1Q8N6N6 113 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MAP6Q96JE9 813 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FRG2BQ96QU4 278 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OR5M11Q96RB7 305 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP26Q9BV47 211 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 APOL5Q9BWW9 433 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CHST8Q9H2A9 424 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 BRF2Q9HAW0 419 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 AMBNQ9NP70 447 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ABCB9Q9NP78 766 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 COPZ2Q9P299 210 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GULP1Q9UBP9 304 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GLS2Q9UI32 602 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ALG5Q9Y673 324 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0G2JMP0 313 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GVI7 797 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PIPSLA2A3N6 862 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PRR33A8MZF0 331 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TLR4O00206 839 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LCE2BO14633 110 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KPNA5O15131 536 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ITGA10O75578 1167 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A5O76082 557 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CDRT1O95170 752 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RAB36O95755 333 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 IFNW1P05000 195 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CYP17A1P05093 508 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OSMP13725 252 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ARSBP15848 533 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CBLP22681 906 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CDH12P55289 794 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GPR85P60893 370 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ILKQ13418 452 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ADAM15Q13444 863 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GALEQ14376 348 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RGNQ15493 299 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PLK5Q496M5 336 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SPIN4Q56A73 249 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 Q5BKY6 102 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.81□□□□□ -1.32
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