RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369031.4

PDSS2-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS2, Length 1,236 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2-201ENST00000369031 MAGED4Q96JG8 741 aa14.85□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 EBF4Q9BQW3 602 aa14.85□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 ANKRD28O15084 1053 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 SUV39H1O43463 412 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 PRAMEF2O60811 474 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 NEURL1O76050 574 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 CASRP41180 1078 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 AQP5P55064 265 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 CLDN8P56748 225 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 TLR1Q15399 786 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 CPTPQ5TA50 214 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 TMEM64Q6YI46 380 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 TMEM156Q8N614 296 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 ASB15Q8WXK1 588 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 TEX37Q96LM6 180 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 DPY30Q9C005 99 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 TRIM4Q9C037 500 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 KLHL1Q9NR64 748 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 LRFN1Q9P244 771 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS2-201ENST00000369031 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 E9PBE3 544 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 GPC1P35052 558 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 CYB561P49447 251 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 IDH3AP50213 366 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 EMDP50402 254 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 HLCSP50747 726 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 MLLT10P55197 1068 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 C21orf58P58505 322 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 UFM1P61960 85 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 C19orf57Q0VDD7 668 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 PGS1Q32NB8 556 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 PIGGQ5H8A4 983 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 ZNF766Q5HY98 468 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 PRR22Q8IZ63 422 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 NPHS2Q9NP85 383 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 TTLL8A6PVC2 850 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 A8MVJ9 347 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 UPK1AO00322 258 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 SLC28A2O43868 658 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 PLOD3O60568 738 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 SLC25A12O75746 678 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 C6orf47O95873 294 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 IL12AP29459 219 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 PMP22Q01453 160 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 LYPD8Q6UX82 237 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 ACAD11Q709F0 780 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 SZRD1Q7Z422 152 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 MDGA2Q7Z553 956 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 COQ8BQ96D53 544 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 ELP4Q96EB1 424 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 DUSP26Q9BV47 211 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 HPF1Q9NWY4 346 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 A0A087WV62 115 aa14.81□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 A0A1W2PRB8 838 aa14.81□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.81□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 UBDO15205 165 aa14.81□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 TGDSO95455 350 aa14.81□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 CORO7P57737 925 aa14.81□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.81□□□□□ -0.04
PDSS2-201ENST00000369031 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms