RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF167Q9H6Y7 350 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 PROM1O43490 865 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 CLDN2P57739 230 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 CD300LDQ6UXZ3 194 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 AMIGO1Q86WK6 493 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 MOAP1Q96BY2 351 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 PRRC1Q96M27 445 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 FBRSQ9HAH7 460 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 OR6C2Q9NZP2 312 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 NARSO43776 548 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 ASGR2P07307 311 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 COL4A2P08572 1712 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 HOXB2P14652 356 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF404Q494X3 552 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 NIPAL1Q6NVV3 410 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 BHLHB9Q6PI77 547 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 ZER1Q7Z7L7 766 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 ATCAYQ86WG3 371 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 ASB12Q8WXK4 309 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 CENPOQ9BU64 300 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 TAPBPLQ9BX59 468 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 SNX7Q9UNH6 387 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 KLK4Q9Y5K2 254 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 A3GALT2U3KPV4 340 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 ISM1B1AKI9 464 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 CASC3O15234 703 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 NME6O75414 186 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 MMP11P24347 488 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 AK4P27144 223 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 BCAP31P51572 246 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP2R2DQ66LE6 453 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 OR9A2Q8NGT5 310 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 C10orf90Q96M02 699 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 OR7D2Q96RA2 312 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 PINK1Q9BXM7 581 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 TWSG1Q9GZX9 223 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 MMP27Q9H306 513 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 DAPK2Q9UIK4 370 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 CA5BQ9Y2D0 317 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 LRP4O75096 1905 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A0G2JPF8 293 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 BTN3A3O00478 584 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 MC3RP41968 323 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 ATAT1Q5SQI0 421 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 PERM1Q5SV97 790 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 KCT2Q8NC54 265 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 OR4E2Q8NGC2 313 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 OR4K5Q8NGD3 323 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 LCN9Q8WX39 176 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 GAL3ST3Q96A11 431 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 GIMAP5Q96F15 307 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 FCRL4Q96PJ5 515 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 MGLLQ99685 303 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 GPA33Q99795 319 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 FNDC11Q9BVV2 318 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 CDADC1Q9BWV3 514 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 ROGDIQ9GZN7 287 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC38A1Q9H2H9 487 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 CD93Q9NPY3 652 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 SCN3AQ9NY46 2000 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1-202ENST00000335475 H0Y8X5 98 aa19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1-202ENST00000335475 H3BN98 237 aa19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1-202ENST00000335475 EMC8O43402 210 aa19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1-202ENST00000335475 KDM1AO60341 852 aa19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1-202ENST00000335475 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1-202ENST00000335475 EGFP01133 1207 aa19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1-202ENST00000335475 NFATC4Q14934 902 aa19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1-202ENST00000335475 SSX1Q16384 188 aa19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1-202ENST00000335475 TJAP1Q5JTD0 557 aa19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms