RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PRR22Q8IZ63 422 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 OR5AR1Q8NGP9 310 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D15Q8TC07 691 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 THRSPQ92748 146 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ISOC1Q96CN7 298 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 I3L521 148 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 APBB3O95704 486 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 STSP08842 583 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 KDELR2P33947 212 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 GRIN2CQ14957 1233 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 IGFN1Q86VF2 1251 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 HHIPQ96QV1 700 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM185BQ9H7F4 350 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 LRR1Q96L50 414 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 GPR52Q9Y2T5 361 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 NFS1Q9Y697 457 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 BCL2L15Q5TBC7 163 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2UQ5VVX9 321 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 HS6ST2Q96MM7 605 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 NELL2Q99435 816 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 GMLQ99445 158 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 H7C417 338 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 PTGESO14684 152 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFV2P19404 249 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 HERPUD2Q9BSE4 406 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ISPDA4D126 451 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF623O75123 536 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 CERS1P27544 350 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC58Q4VC31 144 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 FIBINQ8TAL6 211 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 APIPQ96GX9 242 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 HSPB11Q9Y547 144 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 MAP4K2Q12851 820 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 FAM205BPQ63HN1 556 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM19Q96HH6 336 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF217O75362 1048 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 TRAM1Q15629 374 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 A8MVJ9 347 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 FAM171A2A8MVW0 826 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 VEGFBP49765 207 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 GRM7Q14831 915 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 PNPLA1Q8N8W4 532 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ECHDC3Q96DC8 303 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 C7orf34Q96L11 122 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 FAM210AQ96ND0 272 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 GXYLT2A0PJZ3 443 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 TIMP1P01033 207 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 CEBPBP17676 345 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 GSTM2P28161 218 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 PLBD1Q6P4A8 553 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 IL17RCQ8NAC3 791 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 CLCA1A8K7I4 914 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 FAM189A1O60320 539 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 GKN3PP0CG01 181 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 GNMTQ14749 295 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 MOGQ16653 247 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 MFSD8Q8NHS3 518 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 PEX13Q92968 403 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 LMAN1LQ9HAT1 526 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 H3BQ06 376 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 FESP07332 822 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 KATNBL1Q9H079 304 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0G2JPF8 293 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 YY2O15391 372 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 SFTPDP35247 375 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 SH3BP2P78314 561 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 DCDC5Q6ZRR9 648 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 IQCF1Q8N6M8 205 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 RETREG1Q9H6L5 497 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM184CQ9NVA4 438 aa21.28■■□□□ 1
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