RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 INAVAQ3KP66 663 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TLDC1Q6P9B6 456 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM107Q6UX40 140 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRED1Q7Z699 444 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT73Q86Y46 540 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SVOPLQ8N434 492 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 D2HGDHQ8N465 521 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CBR4Q8N4T8 237 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM86B1Q8N7N1 296 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NUP43Q8NFH3 380 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR9A2Q8NGT5 310 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MIPOL1Q8TD10 442 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC41A2Q96JW4 573 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OSBPL11Q9BXB4 747 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR51I1Q9H343 314 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FANCEQ9HB96 536 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 EXD2Q9NVH0 621 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NTMQ9P121 344 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 P2RX2Q9UBL9 471 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB23Q9ULC3 237 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OAZ3Q9UMX2 235 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 LIPT1Q9Y234 373 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MU76 341 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM150CB9EJG8 249 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 G3V2T6 193 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DENRO43583 198 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXS1O43638 330 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC28A2O43868 658 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS23O95084 383 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 RASAL1O95294 804 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ALBP02768 609 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MT-ND1P03886 318 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP1B1P05026 303 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 IFI6P09912 130 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35E2P0CK97 266 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEA2P43356 314 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CRISP3P54108 245 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SHC2P98077 582 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 STX4Q12846 297 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ANGPT1Q15389 498 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR19Q15760 415 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NRF1Q16656 503 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS41Q7RTY9 318 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ARMC8Q8IUR7 673 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 EID2Q8N6I1 236 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5T3Q8NGG3 340 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMTS15Q8TE58 950 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 KAT2AQ92830 837 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB8BQ92930 207 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MVB12AQ96EY5 273 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF347Q96SE7 839 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CSF3RQ99062 836 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC29A1Q99808 456 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NDC1Q9BTX1 674 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OSBPL10Q9BXB5 764 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTRT3Q9BYD9 372 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CUTCQ9NTM9 273 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CALML5Q9NZT1 146 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 GMEB2Q9UKD1 530 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 LRP4O75096 1905 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CROCCQ5TZA2 2017 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TECTAO75443 2155 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A087WV62 115 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0G2JPF8 293 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM227AF5H4B4 570 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 UPK1AO00322 258 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ASNA1O43681 348 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10H2O60403 315 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms