RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB11BQ15907 218 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 DEFB134Q4QY38 66 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 OR52E2Q8NGJ4 325 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 MAL2Q969L2 176 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PTCHD1Q96NR3 888 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 GJD2Q9UKL4 321 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ADORA3P0DMS8 318 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF84P51523 738 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ERVPABLB-1P60509 514 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SHFQ7M4L6 423 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 OR52N2Q8NGI0 321 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM19Q96HH6 336 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF559Q9BR84 538 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CLDND1Q9NY35 253 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL33A6NCF5 533 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ADRB3P13945 408 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CD34P28906 385 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 NNATQ16517 81 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CPNE5Q9HCH3 593 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 COPZ2Q9P299 210 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 MS4A2Q01362 244 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ISCA2Q86U28 154 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 DEFB119Q8N690 84 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO27Q8NI29 283 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6C74A6NCV1 312 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 BCL2L15Q5TBC7 163 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PLBD1Q6P4A8 553 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM198BQ6UWH4 519 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 GSG1LQ6UXU4 331 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 GDPD1Q8N9F7 314 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ASB15Q8WXK1 588 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PFDN5Q99471 154 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ACOT13Q9NPJ3 140 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR52Q9Y2T5 361 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 B8ZZF3 427 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 GOSR2O14653 212 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB6CQ53S08 254 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF611Q8N823 705 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB6CQ9H0N0 254 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 IL21RQ9HBE5 538 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FZD3Q9NPG1 666 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 VEGFDO43915 354 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKXP51817 358 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 MS4A15Q8N5U1 240 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SPHK2Q9NRA0 654 aa23.03■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF850A8MQ14 1090 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 OPRL1P41146 370 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TAS2R38P59533 333 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PLCXD2Q0VAA5 305 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D15Q8TC07 691 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PGAM5Q96HS1 289 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS21P63220 83 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 MICAQ29983 383 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 C16orf78Q8WTQ4 265 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ECHDC3Q96DC8 303 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 NELFAQ9H3P2 528 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 GPRC5BQ9NZH0 403 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 OSMP13725 252 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ZXDBP98169 803 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 IQCF1Q8N6M8 205 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ITPKCQ96DU7 683 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TCHHQ07283 1943 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 RTCAO00442 366 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PEX12O00623 359 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PM20D2Q8IYS1 436 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 VWA5B2Q8N398 1253 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 NPWQ8N729 165 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 INPP5KQ9BT40 448 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC22A10Q63ZE4 541 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 FTMTQ8N4E7 242 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 LRIG1Q96JA1 1093 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 MVB12BQ9H7P6 319 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL9Q9P2J3 617 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNJ13O60928 360 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 UPK1BO75841 260 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 LAMP1P11279 417 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 FKBP10Q96AY3 582 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFRSF1BP20333 461 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 PLP2Q04941 152 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF616Q08AN1 781 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM35AQ53FP2 167 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 OR52E8Q6IFG1 317 aa23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms