RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290317.9

SLC13A3-202, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC13A3, Length 3,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-202ENST00000290317 FEZF1A0PJY2 475 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ERI3O43414 337 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 B4GAT1O43505 415 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CPNE6O95741 557 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 IGLV3-19P01714 112 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 TUBB3Q13509 450 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PTGR1Q14914 329 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 TAB1Q15750 504 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 HKDC1Q2TB90 917 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF404Q494X3 552 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 COQ5Q5HYK3 327 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 UBQLNLQ8IYU4 475 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ST8SIA4Q92187 359 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 LRRC58Q96CX6 371 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 APIPQ96GX9 242 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 MNTQ99583 582 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ANKHQ9HCJ1 492 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 RDH8Q9NYR8 311 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 TRBC2A0A5B9 178 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 DHRS12A0PJE2 317 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 SDC3O75056 442 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 IGHV4-34P06331 123 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CD1EP15812 388 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 GPX3P22352 226 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 FOXM1Q08050 763 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 GPAT3Q53EU6 434 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 XKR7Q5GH72 579 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF425Q6IV72 752 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 FIGLAQ6QHK4 219 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 GPR135Q8IZ08 494 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 OR8K5Q8NH50 307 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CANT1Q8WVQ1 401 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 NODALQ96S42 347 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PIF1Q9H611 641 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 DMRT3Q9NQL9 472 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 HPF1Q9NWY4 346 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 BRCA2P51587 3418 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 F8W036 122 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CLEC3AO75596 197 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 SYPP08247 313 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PWP1Q13610 501 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 AMZ1Q400G9 498 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC36A3Q495N2 470 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ERICH5Q6P6B1 374 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ABHD13Q7L211 337 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CDH26Q8IXH8 852 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 MARVELD3Q96A59 401 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 VOPP1Q96AW1 172 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CLDN23Q96B33 292 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CSF3RQ99062 836 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 A0A0G2JPF8 293 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PSMB5P28074 263 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 TAS2R50P59544 299 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF45Q02386 682 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 TEKQ02763 1124 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 GPR18Q14330 331 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 FZD2Q14332 565 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ANGPT1Q15389 498 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ASPGQ86U10 573 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 TIGD4Q8IY51 512 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms