RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PLCXD2Q0VAA5 305 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 AAK1Q2M2I8 961 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CHRFAM7AQ494W8 412 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 KDELC1Q6UW63 502 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 HDHD5Q9BXW7 423 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK12Q9HB15 430 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PDE7BQ9NP56 450 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GABRQQ9UN88 632 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PHYHO14832 338 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 KEAP1Q14145 624 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PAGE3Q5JUK9 113 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GDPD1Q8N9F7 314 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD11Q8NFV4 315 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SYT4Q9H2B2 425 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 MTG2Q9H4K7 406 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 BRF2Q9HAW0 419 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 BTNL2Q9UIR0 455 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 MYH8P13535 1937 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC3AO75596 197 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 DHCR24Q15392 516 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD11Q96NU1 681 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 FEZF1A0PJY2 475 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 F5H0A9 414 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 RPS17P08708 135 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 MICAQ29983 383 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 OR8K5Q8NH50 307 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CACNG6Q9BXT2 260 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PELI2Q9HAT8 420 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NANSQ9NR45 359 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPK0 400 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SLC16A8O95907 504 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GPR4P46093 362 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 FNTBP49356 437 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 FRS2Q8WU20 508 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 OR10A4Q9H209 315 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 IL21RQ9HBE5 538 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 AXIN1O15169 862 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 RAD51DO75771 328 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SYN1P17600 705 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF84P51523 738 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PLP2Q04941 152 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SLC15A4Q8N697 577 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 COQ8AQ8NI60 647 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 TRIB2Q92519 343 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R8Q9NYW2 309 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R3Q9NYW6 316 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 MGAT4CQ9UBM8 478 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 IGLON5A6NGN9 336 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM64CA6NLI5 447 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 AGTR1P30556 359 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SELENOWP63302 87 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 HSD11B2P80365 405 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf94Q6P1W5 598 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ITFG2Q969R8 447 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 KCNN3Q9UGI6 736 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PRELID1Q9Y255 219 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC13A5PLN9 417 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 A6NHS1 94 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS56P0CW18 603 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 AGAP5A6NIR3 686 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 FGL1Q08830 312 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CDK5R2Q13319 367 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 RAB33AQ14088 237 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T4Q8NH00 348 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GMEB2Q9UKD1 530 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 RAB3BP20337 219 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GPX3P22352 226 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 RIDAP52758 137 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GTDC1Q4AE62 458 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SSX6Q7RTT6 188 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 HMGN2P46Q86SG4 172 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT10Q86SR1 603 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 MAL2Q969L2 176 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms