RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 A3GALT2U3KPV4 340 aa16.25■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 CD8B2A6NJW9 211 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 ALPPP05187 535 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 CD8BP10966 210 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 TYRP1P17643 537 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 NTSR1P30989 418 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 NTRK2Q16620 822 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 AMZ1Q400G9 498 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 MINDY4Q4G0A6 757 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 PLCZ1Q86YW0 608 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 TESCQ96BS2 214 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 COQ8BQ96D53 544 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 ZSWIM3Q96MP5 696 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 OR5M11Q96RB7 305 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 PSD2Q9BQI7 771 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 OR7A10O76100 309 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGEF15O94989 841 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 CDK10Q15131 360 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 BCL2L15Q5TBC7 163 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 SHFQ7M4L6 423 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 RNF175Q8N4F7 328 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 CSF3RQ99062 836 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 RHNO1Q9BSD3 238 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 IKZF5Q9H5V7 419 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 GDE1Q9NZC3 331 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 MARK1Q9P0L2 795 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 MGAT4AQ9UM21 535 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 FAM25EA8MYX2 175 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 IL3P08700 152 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 PCGF2P35227 344 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 TGFBR2P37173 567 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 MNDAP41218 407 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 DEFA5Q01523 94 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 GPR19Q15760 415 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 LIMS2Q7Z4I7 341 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 UBQLN2Q9UHD9 624 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 ADH1BP00325 375 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 HLA-DQA2P01906 255 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 NT5EP21589 574 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 F8A1P23610 371 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 CTSCP53634 463 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 EOGTQ5NDL2 527 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 LIPIQ6XZB0 460 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 FRRS1Q6ZNA5 592 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC36Q8IYA8 594 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 GPR135Q8IZ08 494 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 SLC5A11Q8WWX8 675 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 PKMYT1Q99640 499 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 PCBD2Q9H0N5 130 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 J3QLW9 94 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 SLC19A2O60779 497 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF19P17023 458 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 PTNP21246 168 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 UQCRC2P22695 453 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 FAM180BQ6P0A1 224 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 BHLHA9Q7RTU4 235 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 OR51I1Q9H343 314 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 BRWD1Q9NSI6 2320 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 GFRA2O00451 464 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 PCDH17O14917 1159 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 TIMP2P16035 220 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 RPS21P63220 83 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 ST3GAL3Q11203 375 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 KCNC3Q14003 757 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 RAB7BQ96AH8 199 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 IKZF2Q9UKS7 526 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 ASB1Q9Y576 335 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 GLOD5A6NK44 160 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 NDUFS4O43181 175 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 RPS5P46782 204 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 PYCR3Q53H96 274 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 C9orf50Q5SZB4 431 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 IER5LQ5T953 404 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 KCT2Q8NC54 265 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 NDC1Q9BTX1 674 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 CACNG6Q9BXT2 260 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM27Q9HBJ8 222 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 GPR52Q9Y2T5 361 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 NOX1Q9Y5S8 564 aa16.23■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 OR6A2O95222 327 aa16.22■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 TGM1P22735 817 aa16.22■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 MTNR1AP48039 350 aa16.22■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 MAN2A2P49641 1150 aa16.22■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa16.22■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 FAM109AQ8N4B1 249 aa16.22■□□□□ 0.19
TRPC1-201ENST00000273482 OR4K5Q8NGD3 323 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms