RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 YBX1P67809 324 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DEFB103AP81534 67 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF91Q05481 1191 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FPGSQ05932 587 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 C10orf53Q8N6V4 93 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR4C15Q8NGM1 316 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 IFT27Q9BW83 186 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RTCAO00442 366 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 COQ9O75208 318 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MT-ND5P03915 603 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SAGP10523 405 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HPGDP15428 266 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 AHRP35869 848 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CASP3P42574 277 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MAP2K3P46734 347 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 AP3S2P59780 193 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 POU4F2Q12837 409 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CCSMST1Q4G0I0 132 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 C22orf42Q6IC83 251 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR14C36Q8NHC7 312 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ASB15Q8WXK1 588 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HS6ST2Q96MM7 605 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MED28Q9H204 178 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MAT2BQ9NZL9 334 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 A0A0G2JN53 185 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FEZF1A0PJY2 475 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 B3GALT4O96024 378 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PSKH1P11801 424 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 NT5EP21589 574 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HOXD12P35452 270 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TSFMP43897 325 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RFX3P48380 749 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ERVK-21P61565 698 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CTBSQ01459 385 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GAS6Q14393 721 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ARTNQ5T4W7 220 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 IDNKQ5T6J7 187 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 UTS2BQ765I0 119 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TMEM203Q969S6 136 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SAMD11Q96NU1 681 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZIC5Q96T25 663 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CENPOQ9BU64 300 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FBRSQ9HAH7 460 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TIGARQ9NQ88 270 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TAAR2Q9P1P5 351 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GFRA2O00451 464 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 LILRB3O75022 631 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ALPPL2P10696 532 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CSF2RAP15509 400 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 NDUFV2P19404 249 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 C5AR1P21730 350 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TGFBR2P37173 567 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ACTC1P68032 377 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ACTA1P68133 377 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HACD4Q5VWC8 232 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TMEM64Q6YI46 380 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FAM129CQ86XR2 697 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR4K3Q96R72 315 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 NEURL2Q9BR09 285 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SLA2Q9H6Q3 261 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CAPN10Q9HC96 672 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CCL26Q9Y258 94 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 WDR45Q9Y484 360 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TMEM202A6NGA9 273 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TMEM221A6NGB7 291 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 STK25O00506 426 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CSO75390 466 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms