RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 FITM2Q8N6M3 262 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SMIM14Q96QK8 99 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 EMC3Q9P0I2 261 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DAPL1A0PJW8 107 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TSPAN11A1L157 253 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PDCD5O14737 125 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TNFSF15O95150 251 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 APOC1P02654 83 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PNMTP11086 282 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CAPZBP47756 277 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 RFLNAQ6ZTI6 216 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 AMER2Q8N7J2 671 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SGTBQ96EQ0 304 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 FAM117AQ9C073 453 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 RNF215Q9Y6U7 377 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 H0Y8X5 98 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ZNF749O43361 778 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 RGS10O43665 173 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PRKD3O94806 890 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 LYNP07948 512 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 FPR1P21462 350 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PSMB5P28074 263 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 IMPA1P29218 277 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SH3BP2P78314 561 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 VMACQ2NL98 169 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 BICRALQ6AI39 1079 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CARM1Q86X55 608 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 APIPQ96GX9 242 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 NUAK2Q9H093 628 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 C1orf21Q9H246 121 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 H0YC42 278 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 H0YIV9 168 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 FAAHO00519 579 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TNFSF14O43557 240 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ALOX12BO75342 701 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CSO75390 466 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 POU2F1P14859 743 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SLC15A1P46059 708 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GALK2Q01415 458 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DSG2Q14126 1118 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 LIX1LQ8IVB5 337 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 FAM217AQ8IXS0 508 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 NGBQ9NPG2 151 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CENPMQ9NSP4 180 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GLS2Q9UI32 602 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 H3BUI4 141 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PGRMC2O15173 223 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PIAS2O75928 621 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GGT5P36269 586 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DLSTP36957 453 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DGCR6Q14129 220 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GRB7Q14451 532 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 KRT77Q7Z794 578 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 FANK1Q8TC84 345 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PMM1Q92871 262 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MVB12AQ96EY5 273 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CD93Q9NPY3 652 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 POLHQ9Y253 713 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SIPA1L1O43166 1804 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 E7ENX8 843 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms