RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rtp4Q9ER80 249 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tinf2Q9QXG9 341 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HraslsQ9QZU4 167 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm15013V9GWY0 266 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glipr1l3A0A1W2P7V2 236 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FcmrA1KXC4 422 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CerklA2AQH1 525 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Skint9A7TZG3 319 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prr36E9PV26 1098 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm14139F6ZS36 494 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sult3a2G5E904 293 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rgs5O08850 181 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IlkO55222 452 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ntf3P20181 258 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ChrneP20782 493 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc6a12P31651 614 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rps25P62852 125 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aup1P70295 410 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd6Q61003 665 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr728Q7TRM6 311 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cst13Q80ZN5 141 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mief1Q8BGV8 463 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mal2Q8BI08 175 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgap22Q8BL80 702 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc25a24Q8BMD8 475 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrtm3Q8BZ81 582 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Piwil4Q8CGT6 848 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sidt2Q8CIF6 832 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdc123Q8CII2 336 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sirt5Q8K2C6 310 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r192Q8K4C9 300 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FlcnQ8QZS3 579 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Camkk1Q8VBY2 505 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rdh10Q8VCH7 341 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1278Q8VF39 313 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1387Q8VFA9 311 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr170Q8VGL6 313 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr572Q8VGZ3 318 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abcg4Q91WA9 646 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhb16Q91Y03 802 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd209aQ91ZX1 238 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam45aQ9D8N2 357 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc107Q9DCC3 242 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Jph3Q9ET77 744 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scamp4Q9JKV5 230 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mcm3apQ9WUU9 1971 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Unc80Q8BLN6 3261 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rp1P56716 2095 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm7792A0A0J9YU01 481 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5141A0A0J9YUW3 581 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3183D3YUJ6 481 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3139J3QK78 481 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3106J3QPH3 481 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1249L7MU51 318 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atxn2O70305 1285 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 OsmrO70458 971 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MbpP04370 250 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdk1P11440 297 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gja1P23242 382 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpind1P49182 478 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 JupQ02257 745 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccser2Q3UHI0 833 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr165Q3V3A3 455 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zdhhc20Q5Y5T1 380 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim46Q7TNM2 759 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Supv3l1Q80YD1 779 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cox14Q8BH51 57 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Shc2Q8BMC3 573 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sumf2Q8BPG6 308 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8C0X8 640 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zbtb9Q8CDC7 459 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf628Q8CJ78 1038 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Coq9Q8K1Z0 313 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Polr1eQ8K202 482 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr315Q8VFG7 309 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr478Q8VG04 314 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Asb16Q8VHS5 453 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrgprb4Q91ZC0 321 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spz1Q99MY0 378 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prkar1aQ9DBC7 381 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Osbpl3Q9DBS9 855 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slco2a1Q9EPT5 643 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adam26aQ9R158 697 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1110002E22RikE0CYV9 1786 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr485A0A140LJF5 317 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ddi2A2ADY9 399 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5938A2AEN9 163 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm6710A2ART0 554 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr59B1ARL3 323 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc9a5B2RXE2 898 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21319F6YNI8 144 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gosr2O35166 212 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chst3O88199 472 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CyctP00015 105 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Limk1P53668 647 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PtnP63089 168 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gng2P63213 71 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adra2aQ01338 450 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nell1Q2VWQ2 810 aa6.27□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q3TYS2 187 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37 ms