RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd53Q3V0J4 497 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm906Q3V0M1 1017 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdk15Q3V3A1 433 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rabl6Q5U3K5 725 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il1rapQ61730 570 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PigaQ64323 485 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IppkQ6P1C1 489 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl13Q80TF4 654 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SnphQ80U23 495 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Amigo2Q80ZD9 519 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tex13c3Q810P0 219 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atg4bQ8BGE6 393 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ablim2Q8BL65 612 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RybpQ8CCI5 228 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr666Q8VH00 318 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gjd3Q91YD1 278 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EedQ921E6 441 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Imp3Q921Y2 184 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hspa14Q99M31 509 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrpl1Q99N96 336 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930553M12RikQ9CUH1 165 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hsd3b7Q9EQC1 369 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hes6Q9JHE6 224 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nubp1Q9R060 320 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Med20Q9R0X0 212 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Col13a1Q9R1N9 751 aa10.35□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A0A1L1ST33 502 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A630010A05RikA9C473 232 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm7849D3YX03 116 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GlsD3Z7P3 674 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r29L7N2D4 852 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpini1O35684 410 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CflarO35732 481 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il13P20109 131 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdcd2P46718 343 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stt3aP46978 705 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc24a2Q14BI1 711 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rsrp1Q3UC65 298 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wfdc5Q4KXB6 126 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd37Q569N2 159 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dhrs9Q58NB6 319 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc16a11Q5NC32 447 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr381Q5SSP0 311 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adam12Q61824 903 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abcg1Q64343 666 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spata24Q6P926 205 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Morn4Q6PGF2 146 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GnptgQ6S5C2 307 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr857Q7TRF7 309 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vac14Q80WQ2 782 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhbdd1Q8BHC7 315 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ska3Q8C263 411 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrif1Q8CDD9 755 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Unc5dQ8K1S2 956 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Actr8Q8R2S9 624 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hsd17b13Q8VCR2 304 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1310Q8VF85 312 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sorcs3Q8VI51 1219 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lgals12Q91VD1 314 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdhb3Q91XZ7 784 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chrm5Q920H4 532 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EtfdhQ921G7 616 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ca15Q99N23 324 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp6cQ9CQR6 305 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Khdc3Q9CWU5 440 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nt5c3aQ9D020 331 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ints12Q9D168 461 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nxnl2Q9D531 156 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chit1Q9D7Q1 464 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mbnl1Q9JKP5 341 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smok2bQ9QYZ3 484 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smok2aQ9QYZ6 504 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdh13Q9WTR5 714 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PrkraQ9WTX2 313 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Entpd5Q9WUZ9 427 aa10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp873A0A1B0GT64 667 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam131cA2ADB2 273 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1076A2AK60 313 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arhgap36B1AUC7 590 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zcchc7B1AX39 541 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3526E9PZM0 191 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp995E9Q6M3 437 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm7535F7CXE4 302 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pot1bH7BX60 640 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r92L7N2A4 860 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tpst2O88856 376 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01635 115 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P04213 122 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ChgbP16014 677 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SagP20443 403 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adra2bP30545 450 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tacr1P30548 407 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mc3rP33033 323 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dpagt1P42867 410 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Krt6aP50446 553 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hcrtr1P58307 416 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem64Q3U145 381 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TepsinQ3U3N6 573 aa10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.9 ms