RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637266.2

SCN2A-215, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,610 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-215ENST00000637266 CKMT2P17540 419 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 IL1RNP18510 177 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 CD34P28906 385 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 AQP1P29972 269 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 SLC26A5P58743 744 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 VITQ6UXI7 678 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 CPXM2Q8N436 756 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 LMLNQ96KR4 655 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 TSSK2Q96PF2 358 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.7□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 HTR3BO95264 441 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 PPM1JQ5JR12 505 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 ELP4Q96EB1 424 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 MAST2Q6P0Q8 1798 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 BANF1O75531 89 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 SOD2P04179 222 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 IFI30P13284 250 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 RAC2P15153 192 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 TAS2R19P59542 299 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 ACBD4Q8NC06 268 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 MGLLQ99685 303 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 MCHR1Q99705 422 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 ASIC5Q9NY37 505 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 MOKQ9UQ07 419 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 FAM149AA5PLN7 773 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 VNN1O95497 513 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 AMY2BP19961 511 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 RGS6P49758 472 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 BMXP51813 675 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 BNIP3Q12983 259 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 C12orf29Q8N999 325 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 FOXJ1Q92949 421 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 RNF38Q9H0F5 515 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 NMUR1Q9HB89 426 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 TMEM100Q9NV29 134 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 ICKQ9UPZ9 632 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF35P13682 527 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 GPR50Q13585 617 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 MPEG1Q2M385 716 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 IQCHQ86VS3 1027 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 ABCG5Q9H222 651 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 TIMM22Q9Y584 194 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 KDM3BQ7LBC6 1761 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 SLC1A7O00341 560 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 LYRM1O43325 122 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 RFPL3O75679 317 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 AHSGP02765 367 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 PCCBP05166 539 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 NTRK2Q16620 822 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 MLIPQ5VWP3 458 aa6.69□□□□□ -1.34
SCN2A-215ENST00000637266 SPRYD7Q5W111 196 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms