RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622020.4

NPHP4-211, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPHP4, Length 3,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-211ENST00000622020 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 MYNNQ9NPC7 610 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 TAC3Q9UHF0 121 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 KCND3Q9UK17 655 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 MGAT4BQ9UQ53 548 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ALG5Q9Y673 324 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CD8B2A6NJW9 211 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CENPBD1B2RD01 187 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CCL16O15467 120 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 RAB36O95755 333 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 LATS1O95835 1130 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CD8BP10966 210 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 TYRP14679 529 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CTBP2P56545 445 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 EFR3AQ14156 821 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 LRRC32Q14392 662 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF750Q32MQ0 723 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 XKRXQ6PP77 449 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ADCK2Q7Z695 626 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 OR6T1Q8NGN1 323 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 RNFT2Q96EX2 444 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 FZD3Q9NPG1 666 aa14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 A0A0X1KG70 313 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 H7BY64 318 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 NR2F6P10588 404 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CELP19835 753 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CCR2P41597 374 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 IL12RB1P42701 662 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 SLC9A3P48764 834 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 INPP1P49441 399 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 PRLHRP49683 370 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 C12orf73Q69YU5 71 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ASB18Q6ZVZ8 466 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ARMC5Q96C12 935 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 SCN5AQ14524 2016 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 A0A0G2JMP0 313 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ALX3O95076 343 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 OLFM2O95897 454 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF33BQ06732 778 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ASAH1Q13510 395 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 RAET1EQ8TD07 263 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 MCUBQ9NWR8 336 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 HSPB11Q9Y547 144 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.91□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ISM1B1AKI9 464 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 FAAHO00519 579 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 PDPK1O15530 556 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 LRG1P02750 347 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 PCSK2P16519 638 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 NAT1P18440 290 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 GPR19Q15760 415 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 BTBD16Q32M84 506 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ADIPOR2Q86V24 386 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 SHISA3A0PJX4 238 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 A8MVJ9 347 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 TGM5O43548 720 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 HRO43593 1189 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ITGB7P26010 798 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ATP6V1E1P36543 226 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms