RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 FUT7Q11130 342 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 GTF2H2Q13888 395 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 VASNQ6EMK4 673 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 OR52E8Q6IFG1 317 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC25Q86WR0 208 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 PM20D2Q8IYS1 436 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF615Q8N8J6 731 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 ADIPOR1Q96A54 375 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 GNRHR2Q96P88 292 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 IPPKQ9H8X2 491 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 CBLCQ9ULV8 474 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 EDARQ9UNE0 448 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 IL2RAP01589 272 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 GBAP04062 536 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 DNASE1P24855 282 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF136P52737 540 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 CAV1Q03135 178 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 ACAP2Q15057 778 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 PACS2Q86VP3 889 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 GALNT12Q8IXK2 581 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 C15orf41Q9Y2V0 281 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 HMX2A2RU54 273 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 CT62P0C5K7 136 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 PIK3R1P27986 724 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 CASP3P42574 277 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 PIK3CGP48736 1102 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 TMED10P49755 219 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 PPP2R2AP63151 447 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.243e-10■■■■■ 45.2
PTPRF-216ENST00000617451 NHSL2Q5HYW2 709 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 MROH9Q5TGP6 573 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 NTNG2Q96CW9 530 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 HSPBAP1Q96EW2 488 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 GPR78Q96P69 363 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 OR10A5Q9H207 317 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A5Q9Y345 797 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 CD8B2A6NJW9 211 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA3DO95025 777 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 MASP1P48740 699 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 NRG3P56975 720 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 GUCY2DQ02846 1103 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 TRADDQ15628 312 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 C17orf47Q8NEP4 570 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 OR4K14Q8NGD5 310 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 ALPK1Q96QP1 1244 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINI1Q99574 410 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 CAMK2AQ9UQM7 478 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL2O95198 593 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN9O95484 217 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 BMP7P18075 431 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 TACR1P25103 407 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 XKP51811 444 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 RPP38P78345 283 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 C2orf54Q08AI8 447 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 MBD6Q96DN6 1003 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 WDYHV1Q96HA8 205 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM41AQ96HV5 264 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 UGT2B28Q9BY64 529 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 A0A096LPK6 155 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 OR7A17O14581 309 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 S1PR1P21453 382 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 ABCD3P28288 659 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 EIPR1Q53HC9 387 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 TIGD3Q6B0B8 471 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 KLC3Q6P597 504 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 PRR22Q8IZ63 422 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 OR7G1Q8NGA0 311 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 CDK15Q96Q40 435 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 TRIB1Q96RU8 372 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 TUBAL3A6NHL2 446 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 KLK1P06870 262 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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