RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608263.5

CTCFL-216, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 4,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-216ENST00000608263 SRMSQ9H3Y6 488 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 DUSP21Q9H596 190 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 COQ3Q9NZJ6 369 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 NUAK1O60285 661 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 YES1P07947 543 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF30P17039 623 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 NT5EP21589 574 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 DCDC1P59894 354 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 CXCR4P61073 352 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 PLAG1Q6DJT9 500 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 PAQR6Q6TCH4 344 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF783Q6ZMS7 281 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 Q8N402 240 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 OR4E2Q8NGC2 313 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 GRHL3Q8TE85 626 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 SAMD11Q96NU1 681 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 NELL2Q99435 816 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 IFT27Q9BW83 186 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 IRAK3Q9Y616 596 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 DAPL1A0PJW8 107 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 OR2A25A4D2G3 310 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 TOXO94900 526 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 DHFRP00374 187 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 MAOBP27338 520 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 SLC6A11P48066 632 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 CCR8P51685 355 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 SMSP52788 366 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 PFN3P60673 137 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 ABATP80404 500 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 CAMK1Q14012 370 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 SYPL1Q16563 259 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 SLC30A6Q6NXT4 461 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 MTFR2Q6P444 385 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 OR8H3Q8N146 312 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 OR8J1Q8NGP2 316 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 TBX21Q9UL17 535 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 GPX2P18283 190 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 IMPA1P29218 277 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 FADDQ13158 208 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 OR8K5Q8NH50 307 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 NEIL3Q8TAT5 605 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 RGMAQ96B86 450 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 INIPQ9NRY2 104 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 ING4Q9UNL4 249 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 MGAT4BQ9UQ53 548 aa9.85□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 FAM172BPA6NC97 362 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 J3QLW9 94 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 ORC5O43913 435 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 GPR37L1O60883 481 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 PTTG1O95997 202 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 IGLV3-27P01718 113 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 CYP17A1P05093 508 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF19P17023 458 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 UQCRC2P22695 453 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 PCGF2P35227 344 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 CASP3P42574 277 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 LRRC32Q14392 662 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 BTBD16Q32M84 506 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 PAMR1Q6UXH9 720 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 KLBQ86Z14 1044 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 OVCA2Q8WZ82 227 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 NEDD4LQ96PU5 975 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 EPYCQ99645 322 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 METTL15A6NJ78 407 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 FAM183AA6NL82 134 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 H0YC42 278 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 PLD2O14939 933 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 ALPPP05187 535 aa9.84□□□□□ -0.83
CTCFL-216ENST00000608263 SPNP16150 400 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms