RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	TAGAP	Q8N103	731 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	CNPY4	Q8N129	248 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC15A4	Q8N697	577 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	KLHL29	Q96CT2	875 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	APIP	Q96GX9	242 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR10A5	Q9H207	317 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	PSME2	Q9UL46	239 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	NCKAP5	O14513	1909 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	FBN3	Q75N90	2809 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989		G3V2L1	256 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCDH7	O60245	1069 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	PROC	P04070	461 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	FREM3	P0C091	2139 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	HTR1E	P28566	365 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	CRHR1	P34998	444 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	NAGLU	P54802	743 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNJ2	P63252	427 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	FUT7	Q11130	342 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC153	Q494R4	210 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	CFAP157	Q5JU67	520 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	LYPD8	Q6UX82	237 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRR22	Q8IZ63	422 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	EID3	Q8N140	333 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	EBPL	Q9BY08	206 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACPT	Q9BZG2	426 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	LDAH	Q9H6V9	325 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	EXO5	Q9H790	373 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	HEY2	Q9UBP5	337 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	MCM8	Q9UJA3	840 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	DNAJC13	O75165	2243 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NEDD4L-233	ENST00000591989	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	11.4	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	CAPN14	A8MX76	684 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989		E9PLN8	166 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	IL3	P08700	152 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	FBXO45	P0C2W1	286 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	CPA3	P15088	417 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	KRT4	P19013	534 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	FOXA1	P55317	472 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	NRG3	P56975	720 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	FBXW4	P57775	412 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	DUSP2	Q05923	314 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC10A1	Q14973	349 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	IMPG1	Q17R60	797 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPIN4	Q56A73	249 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	TDRP	Q86YL5	185 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NEDD4L-233	ENST00000591989	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	11.39	□□□□□ -0.59	1e-6	■■■■■ 58.1
NEDD4L-233	ENST00000591989	DIO2	Q92813	273 aa		11.39	□□□□□ -0.59

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