RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	TM9SF1	O15321	606 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	LINC00032	P0C843	101 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	S1PR1	P21453	382 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	PTGER1	P34995	402 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	C2orf80	Q0P641	193 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	MGAT2	Q10469	447 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	LTB4R	Q15722	352 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	C4orf17	Q53FE4	359 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	TP53INP1	Q96A56	240 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	CFL2	Q9Y281	166 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469		P04436	131 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	STS	P08842	583 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	FBXO45	P0C2W1	286 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	RFC3	P40938	356 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	KIAA0040	Q15053	153 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	LYPD8	Q6UX82	237 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469		Q6ZSR9	355 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	OR2M7	Q8NG81	312 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	OR2T11	Q8NH01	316 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	AGR3	Q8TD06	166 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	DEPP	Q9NTK1	212 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF639	Q9UID6	485 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469		G3V3Y1	287 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PIP5K1B	O14986	540 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	BIRC5	O15392	142 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ASNA1	O43681	348 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	WISP2	O76076	250 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ZWINT	O95229	277 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CCL3	P10147	92 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PCSK2	P16519	638 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CNR1	P21554	472 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	GK5	Q6ZS86	529 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF675	Q8TD23	568 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	MAGED4	Q96JG8	741 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	BBS4	Q96RK4	519 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	FLNC	Q14315	2725 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469		A0A0G2JMM0	328 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469		A0A1B0GUH1	482 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469		A0A1W2PPB8	328 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469		A0A1W2PRS3	328 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	WDR91	A4D1P6	747 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CAPN14	A8MX76	684 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ACOT7	O00154	380 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	LRRTM2	O43300	516 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CBX7	O95931	251 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	SERPINE1	P05121	402 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	GPX3	P22352	226 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ARRB2	P32121	409 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	MPI	P34949	423 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PER3	P56645	1201 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	NRG3	P56975	720 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PLGLB1	Q02325	96 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CEBPE	Q15744	281 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CHI3L2	Q15782	390 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		18.5	■□□□□ 0.55

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