RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXK1P85037 733 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PMP22Q01453 160 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 FUT7Q11130 342 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 LTB4RQ15722 352 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 XKR7Q5GH72 579 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PIGGQ5H8A4 983 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM64Q6YI46 380 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MDGA2Q7Z553 956 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 LGI4Q8N135 537 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 LIX1Q8N485 282 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MDS2Q8NDY4 140 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 OR8K3Q8NH51 312 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 NUDT8Q8WV74 236 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MIB2Q96AX9 1013 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MAGED4Q96JG8 741 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 C5orf34Q96MH7 638 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 RASL10BQ96S79 203 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 CCT7Q99832 543 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SH3GL2Q99962 352 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 NUF2Q9BZD4 464 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MYNNQ9NPC7 610 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 THAP1Q9NVV9 213 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 OR6C76A6NM76 312 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 A8MVJ9 347 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC25A12O75746 678 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 WISP2O76076 250 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 WISP1O95388 367 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP1B1P05026 303 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PRPS2P11908 318 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 GNLYP22749 145 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MAPK1P28482 360 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 RFC3P40938 356 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ATRXP46100 2492 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ASMTP46597 345 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR85P60893 370 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP2R2AP63151 447 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNC4Q03721 635 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 EMX2Q04743 252 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 DUSP8Q13202 625 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MPEG1Q2M385 716 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF385BQ569K4 471 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 OPN5Q6U736 354 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ATCAYQ86WG3 371 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SULF2Q8IWU5 870 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PRR22Q8IZ63 422 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 NUBPLQ8TB37 319 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 FAR1Q8WVX9 515 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PPCDCQ96CD2 204 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SCMH1Q96GD3 660 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms