RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR10A5Q9H207 317 aa16.19■□□□□ 0.18
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CCNDBP1-204ENST00000563065 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 PIGGQ5H8A4 983 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 CPTPQ5TA50 214 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 FHL5Q5TD97 284 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM64Q6YI46 380 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM156Q8N614 296 aa16.16■□□□□ 0.18
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CCNDBP1-204ENST00000563065 ACTRT2Q8TDY3 377 aa16.16■□□□□ 0.18
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