RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 REEP4Q9H6H4 257 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC167Q9P0B6 97 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 MYO1GB0I1T2 1018 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 IDSB3KWA1 339 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 NR5A2O00482 541 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 SOCS6O14544 535 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TBX19O60806 448 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 VPS4BO75351 444 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CBX6O95503 412 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 C1QTNF9P0C862 333 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 PRPS2P11908 318 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 RNH1P13489 461 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 IDO1P14902 403 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 S1PR1P21453 382 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 AVPR1BP47901 424 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CPA2P48052 419 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 Q0VFX4 171 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 MAP7Q14244 749 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 SQLEQ14534 574 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TERF2Q15554 542 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 NDUFA9Q16795 377 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 VPS26BQ4G0F5 336 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 FHL5Q5TD97 284 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 MLIPQ5VWP3 458 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 PRMT9Q6P2P2 845 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 SNX32Q86XE0 403 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 MIER2Q8N344 545 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TESCQ96BS2 214 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 AMDHD1Q96NU7 426 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 USP22Q9UPT9 525 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 ACACBO00763 2458 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 C1orf226A1L170 272 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 A8MUA0 341 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 SLC22A3O75751 556 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 UBOX5O94941 541 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 DDAH2O95865 285 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 C6orf47O95873 294 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CBX7O95931 251 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 GSNP06396 782 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 COX6A1P12074 109 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CPMP14384 443 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 COX7A2P14406 83 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TCN2P20062 427 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 PRPS1L1P21108 318 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 DLSTP36957 453 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 GPR143P51810 404 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 MVDP53602 400 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CASP9P55211 416 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 HBA1P69905 142 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 DNASE1L3Q13609 305 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 PCOLCEQ15113 449 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 GSTA3Q16772 222 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 PGS1Q32NB8 556 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF628Q5EBL2 1059 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 SLC6A19Q695T7 634 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 OR52E8Q6IFG1 317 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM205Q6UW68 189 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 KIRREL2Q6UWL6 708 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 DLEU7Q6UYE1 221 aa7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms