RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LACC1	Q8IV20	430 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	KRT78	Q8N1N4	520 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LIX1	Q8N485	282 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	OR2L5	Q8NG80	312 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SH3GL2	Q99962	352 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	AICDA	Q9GZX7	198 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CNIH4	Q9P003	139 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CBLC	Q9ULV8	474 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	DAPP1	Q9UN19	280 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PLLP	Q9Y342	182 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SPG11	Q96JI7	2443 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	HCFC1	P51610	2035 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688		A0A0G2JMM0	328 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PPB8	328 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PRS3	328 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	C17orf105	B2RV13	164 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688		G3V3Y1	287 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	STX16	O14662	325 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TYROBP	O43914	113 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	IL18BP	O95998	194 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TGFB1	P01137	390 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CHRNG	P07510	517 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GSTA1	P08263	222 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CELA3A	P09093	270 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CCL3	P10147	92 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	COX7A2	P14406	83 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TACR1	P25103	407 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PPP2R1B	P30154	601 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	OPRM1	P35372	400 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	HTR6	P50406	440 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PLA2G16	P53816	162 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PRKAA2	P54646	552 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NAGLU	P54802	743 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	FOXA1	P55317	472 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LIM2	P55344	173 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	HERVK_113	P63132	956 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	KCNJ2	P63252	427 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CLC	Q05315	142 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TRAF3	Q13114	568 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MPP2	Q14168	576 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	RASA2	Q15283	850 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	6.3	□□□□□ -1.4	9e-14	■■■□□ 15.6
CS-233	ENST00000552688	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CCDC153	Q494R4	210 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TTMP	Q5BVD1	217 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	HDX	Q7Z353	690 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4

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