RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545264.1

CCDC82-208, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC82, Length 557 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-208ENST00000545264 NDST1P52848 882 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 ERVPABLB-1P60509 514 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 PRKCEQ02156 737 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 IFI44LQ53G44 452 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 TAF3Q5VWG9 929 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 STHQ8IWL8 128 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 RDH11Q8TC12 318 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 TSPYL1Q9H0U9 437 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 DCTPP1Q9H773 170 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 ACOXLQ9NUZ1 547 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 IL17CQ9P0M4 197 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 PRODH2Q9UF12 536 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 KIF7Q2M1P5 1343 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 A0A0A6YYD4 124 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 H0Y9J4 135 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 ZNF263O14978 683 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 SLC7A4O43246 635 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 IGHV3-9P01782 118 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 SFTPBP07988 381 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 PRG2P13727 222 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 PRKAR2BP31323 418 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 CTNNB1P35222 781 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 RCN2Q14257 317 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 KIAA0040Q15053 153 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 GLRA4Q5JXX5 417 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 TATDN1Q6P1N9 297 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 ASRGL1Q7L266 308 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 PRSS42Q7Z5A4 293 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 LUZP1Q86V48 1076 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 UBQLNLQ8IYU4 475 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 NAT8LQ8N9F0 302 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 OR5M11Q96RB7 305 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 FAM173AQ9BQD7 235 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 FUT8Q9BYC5 575 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 TRIM9Q9C026 710 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 TRPC4Q9UBN4 977 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 EMCNQ9ULC0 261 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 A0A1W2PRQ8 180 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 HDAC3O15379 428 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 SLC35E2P0CK97 266 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 LAMP1P11279 417 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 HERV-K104P63124 156 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 SLMAPQ14BN4 828 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 TGIF1Q15583 401 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 SEL1L2Q5TEA6 688 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 MFSD7Q6UXD7 560 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 STOX1Q6ZVD7 989 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 KRT77Q7Z794 578 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 FAF2Q96CS3 445 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 GPR174Q9BXC1 333 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 OSBPL8Q9BZF1 889 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 ADAM22Q9P0K1 906 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 MAD2L2Q9UI95 211 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 STX8Q9UNK0 236 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 A8MX80 341 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 CYB561D2O14569 222 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 SH2D1BO14796 132 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 REC8O95072 547 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 TGDSO95455 350 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 OAS1P00973 400 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 SERPINF2P08697 491 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 PVRP15151 417 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 ACP1P24666 158 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 TRIM23P36406 574 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 ARHGDIBP52566 201 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 SMSP52788 366 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 KRT31Q15323 416 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 EPC2Q52LR7 807 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 MS4A13Q5J8X5 152 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 SLCO4A1Q96BD0 722 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 CASD1Q96PB1 797 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 IKZF5Q9H5V7 419 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 VPS54Q9P1Q0 977 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms