RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543754.1

PUS1-209, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PUS1, Length 1,378 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-209ENST00000543754 PROCP04070 461 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 CCL3P10147 92 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 NR2F6P10588 404 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 KRT4P19013 534 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 TNNI3P19429 210 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 ACVR2AP27037 513 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 GALNSP34059 522 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 STT3AP46977 705 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 WNT3P56703 355 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 DNAJB13P59910 316 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 SLC18A2Q05940 514 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 OR52E8Q6IFG1 317 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 LETMD1Q6P1Q0 360 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 ZNF585AQ6P3V2 769 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 HSDL2Q6YN16 418 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 METTL4Q8N3J2 472 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 MREGQ8N565 214 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 OR5L2Q8NGL0 311 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 OR5M3Q8NGP4 307 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 DOK4Q8TEW6 326 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 DGAT2Q96PD7 388 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 SMC6Q96SB8 1091 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 PROK2Q9HC23 129 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 MKS1Q9NXB0 559 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 MYOTQ9UBF9 498 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 VPS29Q9UBQ0 182 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 COPS7AQ9UBW8 275 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 LGALS13Q9UHV8 139 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 EMCNQ9ULC0 261 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 ATG4BQ9Y4P1 393 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 ASB4Q9Y574 426 aa10.13□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 SERTM1A2A2V5 107 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 SMIM23A6NLE4 172 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 A8MVJ9 347 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 G3V2L1 256 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 MANBAO00462 879 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 TMPRSS11DO60235 418 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 FGF17O60258 216 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 LDB3O75112 727 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 ULK1O75385 1050 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 EEDO75530 441 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 OR4F21O95013 312 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 GPR75O95800 540 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 PDYNP01213 254 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 RFPL3SP0C7P2 107 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 CPA3P15088 417 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 KLK2P20151 261 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 HMOX2P30519 316 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 PIGAP37287 484 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 PLGLB1Q02325 96 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 ID2Q02363 134 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 ASPHQ12797 758 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 MYBPHQ13203 477 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 CFAP157Q5JU67 520 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 LYPD8Q6UX82 237 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 ZZZ3Q8IYH5 903 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 EID3Q8N140 333 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 CDYL2Q8N8U2 506 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 NAXEQ8NCW5 288 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 METTL6Q8TCB7 284 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 FOXC2Q99958 501 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 TMEM109Q9BVC6 243 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 SH2D2AQ9NP31 389 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 OXSMQ9NWU1 459 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 HPF1Q9NWY4 346 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 ZNF225Q9UK10 706 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 SLC12A4Q9UP95 1085 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 ERVK-11Q9UQG0 969 aa10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 MPDZO75970 2070 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 NINQ8N4C6 2090 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 A0A1B0GTL3 188 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 A0A1W2PR48 441 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 TLDC2A0PJX2 215 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 FOXO6A8MYZ6 492 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 HRKO00198 91 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 PPP6CO00743 305 aa10.11□□□□□ -0.79
PUS1-209ENST00000543754 AIFM1O95831 613 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms