RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PRAMEF2	O60811	474 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SCN2B	O60939	215 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	GSN	P06396	782 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	IFI6	P09912	130 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	F8A1	P23610	371 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PTGER1	P34995	402 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CDKN2C	P42773	168 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PRIM2	P49643	509 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	AP2B1	P63010	937 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MAP4K2	Q12851	820 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	EXT1	Q16394	746 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	BROX	Q5VW32	411 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CPZ	Q66K79	652 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM64	Q6YI46	380 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MORN4	Q8NDC4	146 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ELP4	Q96EB1	424 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CGREF1	Q99674	301 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SH3GL1	Q99961	368 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	EQTN	Q9NQ60	294 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	DKK4	Q9UBT3	224 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PRODH2	Q9UF12	536 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	IL17B	Q9UHF5	180 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CFL2	Q9Y281	166 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SPTBN2	O15020	2390 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658		A0A087WV62	115 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658		B2RBV5	119 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PLOD2	O00469	737 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SOCS6	O14544	535 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PLOD3	O60568	738 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	HP	P00738	406 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CT62	P0C5K7	136 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ICAM2	P13598	275 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CD1E	P15812	388 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CLCN2	P51788	898 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	EFNA3	P52797	238 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	IL10RA	Q13651	578 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	BTBD16	Q32M84	506 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	RETREG3	Q86VR2	466 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	OR7G2	Q8NG99	324 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	DOK4	Q8TEW6	326 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	JADE3	Q92613	823 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC58	Q96CX6	371 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	VMP1	Q96GC9	406 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	FBXL20	Q96IG2	436 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SERHL	Q9NQF3	203 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	OR6C76	A6NM76	312 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	UNC5C	O95185	931 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	PRKAR1A	P10644	381 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	COX6A1	P12074	109 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	SSTR4	P31391	388 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	KHK	P50053	298 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	RRAD	P55042	308 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	SLC26A5	P58743	744 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	BNIP1	Q12981	228 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDB1-223	ENST00000543658	GAB1	Q13480	694 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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