RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AAGABQ6PD74 315 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNX31Q8N9S9 440 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR56A3Q8NH54 315 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TP53INP1Q96A56 240 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERINC2Q96SA4 455 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCF12Q99081 682 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHP1Q99653 195 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PINK1Q9BXM7 581 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TFR2Q9UP52 801 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa9.14□□□□□ -0.95
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGF17O60258 216 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAMP1O60894 148 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LY6HO94772 140 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MGAT1P26572 445 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NEK2P51955 445 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C21orf58P58505 322 aa9.14□□□□□ -0.95
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB35Q15286 201 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSC22D1Q15714 1073 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCMAPQ5T1S8 102 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UGT3A1Q6NUS8 523 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM40Q6P9F5 258 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FNDC9Q8TBE3 224 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf105Q8TEF2 133 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXL20Q96IG2 436 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC42Q96M95 316 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRR14Q9BWN1 585 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTR8Q9H981 624 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM89A2RUT3 159 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMTNL1A8MU46 457 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTNL10A8MVZ5 291 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC14L5O43304 696 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ICOSLGO75144 302 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CBR3O75828 277 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C8GP07360 202 aa9.13□□□□□ -0.95
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FDFT1P37268 417 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC37A1P57057 533 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5M10Q6IEU7 315 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.13□□□□□ -0.95
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TREML4Q6UXN2 200 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDSUB1Q8N9V3 476 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2L5Q8NG80 312 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PROX1Q92786 737 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNJ9Q92806 393 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S100PBPQ96BU1 408 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2B2Q9GZK3 357 aa9.13□□□□□ -0.95
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PELI2Q9HAT8 420 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOLH1BQ9HBA9 442 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNX15Q9NRS6 342 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYBUQ9NX95 663 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC22A14Q9Y267 594 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SH3BGRLO75368 114 aa9.12□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FESP07332 822 aa9.12□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPN2P22792 545 aa9.12□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNTFP26441 200 aa9.12□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSTR4P31391 388 aa9.12□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPN7P35236 360 aa9.12□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CETN2P41208 172 aa9.12□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TERF1P54274 439 aa9.12□□□□□ -0.95
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