RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 FRKP42685 505 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 PLIN5Q00G26 463 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.513e-7■■□□□ 12.2
RPUSD4-208ENST00000533628 EXT1Q16394 746 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 NXNQ6DKJ4 435 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 B3GNT7Q8NFL0 401 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 OR14A16Q8NHC5 309 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 ELP5Q8TE02 316 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 COQ8BQ96D53 544 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 SIKE1Q9BRV8 207 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 BRINP2Q9C0B6 783 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 SEMA4CQ9C0C4 833 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 CXorf21Q9HAI6 301 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 MMP25Q9NPA2 562 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 SLAMF7Q9NQ25 335 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 TCF7L2Q9NQB0 619 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 MIEF1Q9NQG6 463 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 SH3GLB1Q9Y371 365 aa11.86□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 C17orf105B2RV13 164 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 HRKO00198 91 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 CLPSP04118 112 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 IGKV3-11P04433 115 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 CT62P0C5K7 136 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 PRPS1L1P21108 318 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 S1PR1P21453 382 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 ACAD11Q709F0 780 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 CAMKMTQ7Z624 323 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF321PQ8N8H1 164 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 MORN4Q8NDC4 146 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 OR7A2PQ8NGA2 310 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 DOK4Q8TEW6 326 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF721Q8TF20 911 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 TEX37Q96LM6 180 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF639Q9UID6 485 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 DCTN4Q9UJW0 460 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 ITGAMP11215 1152 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 ICAM2P13598 275 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 IL12AP29459 219 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 CCL11P51671 97 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 MAP4K2Q12851 820 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 BTBD16Q32M84 506 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 LIN52Q52LA3 116 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 H3F3CQ6NXT2 135 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 PCSK4Q6UW60 755 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF554Q86TJ5 538 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 KBTBD2Q8IY47 623 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 CCDC116Q8IYX3 515 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 GALNT16Q8N428 558 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 CLEC1AQ8NC01 280 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 RIT1Q92963 219 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 PPCDCQ96CD2 204 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 MARK4Q96L34 752 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 NUDT9Q9BW91 350 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 MAT2BQ9NZL9 334 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 KLHL14Q9P2G3 628 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa11.85□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 UBDO15205 165 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 OR10H2O60403 315 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 LAMP1P11279 417 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 PCSK2P16519 638 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 TNNI3P19429 210 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 PTGER1P34995 402 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 HPCAL1P37235 193 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 RPL3P39023 403 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 UFM1P61960 85 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 RHDQ02161 417 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 FUT7Q11130 342 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 LTB4RQ15722 352 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF628Q5EBL2 1059 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM111BQ6SJ93 734 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 FDCSPQ8NFU4 85 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC2A12Q8TD20 617 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF675Q8TD23 568 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 NCLNQ969V3 563 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 FBXL20Q96IG2 436 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 AMDHD1Q96NU7 426 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 LHPPQ9H008 270 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 GLIPR2Q9H4G4 154 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 DOCK10Q96BY6 2186 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 CROCCQ5TZA2 2017 aa11.84□□□□□ -0.51
RPUSD4-208ENST00000533628 ITPR1Q14643 2758 aa11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms