RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

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Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-208ENST00000515588 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.53□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 NPIPB8E9PQR5 432 aa14.53□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 ASNA1O43681 348 aa14.53□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 BPGMP07738 259 aa14.53□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 FGF4P08620 206 aa14.53□□□□□ -0.08
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SERF1B-208ENST00000515588 HSF1Q00613 529 aa14.53□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.53□□□□□ -0.08
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SERF1B-208ENST00000515588 TMEM64Q6YI46 380 aa14.53□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
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SERF1B-208ENST00000515588 SLC15A4Q8N697 577 aa14.53□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.53□□□□□ -0.08
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SERF1B-208ENST00000515588 OR2M7Q8NG81 312 aa14.53□□□□□ -0.08
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SERF1B-208ENST00000515588 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.53□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.53□□□□□ -0.08
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SERF1B-208ENST00000515588 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.53□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.53□□□□□ -0.08
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa14.53□□□□□ -0.08
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SERF1B-208ENST00000515588 CBX7O95931 251 aa14.52□□□□□ -0.09
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SERF1B-208ENST00000515588 PRPH2P23942 346 aa14.52□□□□□ -0.09
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SERF1B-208ENST00000515588 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.52□□□□□ -0.09
SERF1B-208ENST00000515588 C2orf80Q0P641 193 aa14.52□□□□□ -0.09
SERF1B-208ENST00000515588 MPP2Q14168 576 aa14.52□□□□□ -0.09
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SERF1B-208ENST00000515588 NOXRED1Q6NXP6 359 aa14.52□□□□□ -0.09
SERF1B-208ENST00000515588 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.52□□□□□ -0.09
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SERF1B-208ENST00000515588 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.52□□□□□ -0.09
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SERF1B-208ENST00000515588 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SERF1B-208ENST00000515588 SLC19A2O60779 497 aa14.51□□□□□ -0.09
SERF1B-208ENST00000515588 SEC22BO75396 215 aa14.51□□□□□ -0.09
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SERF1B-208ENST00000515588 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.51□□□□□ -0.09
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SERF1B-208ENST00000515588 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.51□□□□□ -0.09
SERF1B-208ENST00000515588 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.51□□□□□ -0.09
SERF1B-208ENST00000515588 C1orf109Q9NX04 203 aa14.51□□□□□ -0.09
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.51□□□□□ -0.09
SERF1B-208ENST00000515588 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SERF1B-208ENST00000515588 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.5□□□□□ -0.09
SERF1B-208ENST00000515588 A0A1B0GUH1 482 aa14.5□□□□□ -0.09
SERF1B-208ENST00000515588 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.5□□□□□ -0.09
SERF1B-208ENST00000515588 TFECO14948 347 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
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