RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TSPAN8P19075 237 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 AXLP30530 894 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 FCGR2CP31995 323 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 DLSTP36957 453 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 CRYBA2P53672 197 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PEX3P56589 373 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 HERVK_113P63132 956 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ERVK-8P63133 956 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 VPS36Q86VN1 386 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SLCO2A1Q92959 643 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 LRR1Q96L50 414 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 VPS35Q96QK1 796 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 COG4Q9H9E3 785 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 CALHM2Q9HA72 323 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 FZR1Q9UM11 496 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 B9D1Q9UPM9 204 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 KDRP35968 1356 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 H3BMH7 237 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SDHDO14521 159 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 RIPK2O43353 540 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNAB3O43448 404 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 NXPH4O95158 308 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 MBD3O95983 291 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 CLUP10909 449 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 AOC1P19801 751 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PRKACGP22612 351 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ANOS1P23352 680 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 HTR2AP28223 471 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PDHA2P29803 388 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ACTR1AP61163 376 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 CBLN3Q6UW01 205 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 KIF6Q6ZMV9 814 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 OR4F5Q8NH21 305 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 C4orf36Q96KX1 117 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 FKBP7Q9Y680 259 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 AFF2P51816 1311 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 SPAG6O75602 509 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 GSTA1P08263 222 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 NDST2P52849 883 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 NAPAP54920 295 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 SRYQ05066 204 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 ENPP2Q13822 863 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 C3P1Q6ZMU1 363 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF519Q8TB69 540 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 VSTM2LQ96N03 204 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 TTC25Q96NG3 672 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 USP28Q96RU2 1077 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 TESK2Q96S53 571 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 H0YL77 283 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 TBX19O60806 448 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 AMBPP02760 352 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 CD1DP15813 335 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 RFC2P35250 354 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 ERVK-16P61578 105 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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