RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 UQCRC1P31930 480 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 MASP1P48740 699 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 WNT3P56703 355 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 TRAF3Q13114 568 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 SGO1Q5FBB7 561 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 FNDC7Q5VTL7 733 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 PACS2Q86VP3 889 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 PRR22Q8IZ63 422 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 NAXEQ8NCW5 288 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 TNIP2Q8NFZ5 429 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 GNRHR2Q96P88 292 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 TIMP4Q99727 224 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 NTMT1Q9BV86 223 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 ANGPTL4Q9BY76 406 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 AHSPQ9NZD4 102 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 PCTPQ9UKL6 214 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 SPG11Q96JI7 2443 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 SYT5O00445 386 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 STX16O14662 325 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CTAG2O75638 210 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 EPPINO95925 133 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 HPNP05981 417 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 RBP1P09455 135 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CPMP14384 443 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 BMP5P22003 454 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CASP3P42574 277 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 MAGEA12P43365 314 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 KIR2DL3P43628 341 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 TMED10P49755 219 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CDK9P50750 372 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 IST1P53990 364 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 NRG3P56975 720 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 C6orf163Q5TEZ5 329 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 C8orf74Q6P047 294 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 PAGE2Q7Z2X7 111 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 UBQLN3Q9H347 655 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 XPR1Q9UBH6 696 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 ADAM29Q9UKF5 820 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 TMCO1Q9UM00 188 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 DTX4Q9Y2E6 619 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 C15orf41Q9Y2V0 281 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 SLC6A5Q9Y345 797 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 IKBKGQ9Y6K9 419 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 DVL2O14641 736 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 SMIM24O75264 130 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 PORP16435 677 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 S1PR1P21453 382 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 GPX3P22352 226 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 MAPK12P53778 367 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 IFT88Q13099 833 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 TOMM20Q15388 145 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 VASNQ6EMK4 673 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 MILR1Q7Z6M3 343 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 METTL4Q8N3J2 472 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 C17orf47Q8NEP4 570 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 OR7G1Q8NGA0 311 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 OR4F6Q8NGB9 312 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 SLC44A1Q8WWI5 657 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 ISL2Q96A47 359 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 ELOVL6Q9H5J4 265 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 CRIM1Q9NZV1 1036 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 A0A1B0GTL3 188 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 PPP6CO00743 305 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 GNB5O14775 395 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 INHBAP08476 426 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 KRT15P19012 456 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 ABCD3P28288 659 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 ASCL1P50553 236 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 RPP38P78345 283 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 MGAT2Q10469 447 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 NNATQ16517 81 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 GGTA1PQ4G0N0 100 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 DESI1Q6ICB0 168 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 POMZP3Q6PJE2 187 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 FAM111BQ6SJ93 734 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 LACC1Q8IV20 430 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 MMP21Q8N119 569 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 TMEM41AQ96HV5 264 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 SH3GL2Q99962 352 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-211ENST00000513325 FUT8Q9BYC5 575 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms