RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 XKP51811 444 aa22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 NRG3P56975 720 aa22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 FBXW4P57775 412 aa22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 SGO1Q5FBB7 561 aa22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM198Q66K66 360 aa22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM64Q6YI46 380 aa22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 COMMD6Q7Z4G1 85 aa22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 CLYBLQ8N0X4 340 aa22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF615Q8N8J6 731 aa22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 NEIL3Q8TAT5 605 aa22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF592Q92610 1267 aa22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 Q9UFV3 132 aa22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 EXPH5Q8NEV8 1989 aa22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ALYREF-203ENST00000511412 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD33BA6NCL7 494 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 A8MT66 165 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 LETMD1Q6P1Q0 360 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 MNS1Q8NEH6 495 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 OR7G1Q8NGA0 311 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 SPPL2AQ8TCT8 520 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 SELENOMQ8WWX9 145 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 SLC24A3Q9HC58 644 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 SNX6Q9UNH7 406 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 AKAP9Q99996 3911 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 POLQO75417 2590 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 TACC2O95359 2948 aa22.64■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 A0A1B0GTL3 188 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 C1orf226A1L170 272 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 PORP16435 677 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 ADH7P40394 386 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 TRPC1P48995 793 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 RPP38P78345 283 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 SLC48A1Q6P1K1 146 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 VWA5B2Q8N398 1253 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 C17orf47Q8NEP4 570 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 TRPC4APQ8TEL6 797 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 ADIPOR1Q96A54 375 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 RILPQ96NA2 401 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF559Q9BR84 538 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 BRF2Q9HAW0 419 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 KCNN3Q9UGI6 736 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 TRPS1Q9UHF7 1281 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa22.63■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 SNX4O95219 450 aa22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 PDYNP01213 254 aa22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 CTAGE8P0CG41 777 aa22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 KRT15P19012 456 aa22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 TSPAN8P19075 237 aa22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 MASP1P48740 699 aa22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 CDH13P55290 713 aa22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 BICRALQ6AI39 1079 aa22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 ULK2Q8IYT8 1036 aa22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 PRR22Q8IZ63 422 aa22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 BRINP2Q9C0B6 783 aa22.62■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 NINQ8N4C6 2090 aa22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 PPP6CO00743 305 aa22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 SBK3P0C264 359 aa22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 GPX3P22352 226 aa22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 DUSP8Q13202 625 aa22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 MYBPHQ13203 477 aa22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM200AQ86VY9 491 aa22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 LIX1LQ8IVB5 337 aa22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 ANGPTL4Q9BY76 406 aa22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 NMRK1Q9NWW6 199 aa22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 CES1P1Q9UKY3 287 aa22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 CFL2Q9Y281 166 aa22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 ATP1B1P05026 303 aa22.6■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 ABCD3P28288 659 aa22.6■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa22.6■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 TEX35Q5T0J7 233 aa22.6■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 LGSNQ5TDP6 509 aa22.6■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 CES4AQ5XG92 561 aa22.6■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 PACS2Q86VP3 889 aa22.6■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 MMP21Q8N119 569 aa22.6■■□□□ 1.21
ALYREF-203ENST00000511412 KLHL29Q96CT2 875 aa22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms