RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ALG11	Q2TAA5	492 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ARSI	Q5FYB1	569 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OR8S1	Q8NH09	359 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	LCN9	Q8WX39	176 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TEX46	H3BTG2	121 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PCDHGA12	O60330	932 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	APOC1	P02654	83 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PCCB	P05166	539 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RAB5B	P61020	215 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OR5M11	Q96RB7	305 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	THSD1	Q9NS62	852 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	DEC1	Q9P2X7	70 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	REN	P00797	406 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	HTR1A	P08908	422 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	S100A2	P29034	98 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	BEST3	Q8N1M1	668 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FKBP10	Q96AY3	582 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OTUB2	Q96DC9	234 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MUSK	O15146	869 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TSPAN6	O43657	245 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ARSB	P15848	533 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ARHGDIB	P52566	201 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	KCTD9	Q7L273	389 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RDH14	Q9HBH5	336 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PRAF2	O60831	178 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GPR37L1	O60883	481 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GPR32	O75388	356 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ADH1C	P00326	375 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RAB40B	Q12829	278 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SCD5	Q86SK9	330 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OR51A7	Q8NH64	312 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SGTB	Q96EQ0	304 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OR2M2	Q96R28	347 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MROH6	A6NGR9	719 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FABP7	O15540	132 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GIMD1	P0DJR0	217 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	BPI	P17213	487 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CBX5	P45973	191 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	WASH4P	A8MWX3	477 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	B3GALT2	O43825	422 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	STATH	P02808	62 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GIF	P27352	417 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PDZD3	Q86UT5	571 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OR2L3	Q8NG85	312 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	C5orf34	Q96MH7	638 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MBOAT4	Q96T53	435 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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