RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494422.1

BRD9-211, Transcript of bromodomain containing 9, humanhuman

TSL 3

Gene BRD9, Length 449 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD9-211ENST00000494422 ATP1A4Q13733 1029 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 MYBPC3Q14896 1274 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 PTGR1Q14914 329 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ST3GAL2Q16842 350 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 MPEG1Q2M385 716 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 BTBD16Q32M84 506 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 VPS26BQ4G0F5 336 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CRB2Q5IJ48 1285 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 H3F3CQ6NXT2 135 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 TMEM64Q6YI46 380 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 MAVSQ7Z434 540 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SPATA21Q7Z572 469 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ARMC10Q8N2F6 343 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 GALNT16Q8N428 558 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ANKS4BQ8N8V4 417 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CDC26Q8NHZ8 85 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 PSMA8Q8TAA3 256 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SFXN5Q8TD22 340 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ELP5Q8TE02 316 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 OR5P2Q8WZ92 322 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 TSLPQ969D9 159 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 TP53INP1Q96A56 240 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 EGLN2Q96KS0 407 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 PPP1R36Q96LQ0 422 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ZNF354BQ96LW1 612 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 OR52B2Q96RD2 323 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 LMF1Q96S06 567 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 DUSP26Q9BV47 211 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 RNF32Q9H0A6 362 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CXorf21Q9HAI6 301 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 KCNK13Q9HB14 408 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 HHATLQ9HCP6 504 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 GIN1Q9NXP7 522 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 TAS2R9Q9NYW1 312 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 HEY2Q9UBP5 337 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ZNF639Q9UID6 485 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 BTNL2Q9UIR0 455 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 FBXL4Q9UKA2 621 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ADAM21Q9UKJ8 722 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ACACAQ13085 2346 aa5.96□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ARGFXA6NJG6 315 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 GLOD5A6NK44 160 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 WASHC1A8K0Z3 465 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 BBIP1A8MTZ0 92 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ACOX3O15254 700 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CFLARO15519 480 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SNX3O60493 162 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 DCTN3O75935 186 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 AGR2O95994 175 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 NPPAP01160 153 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 IGKV3-11P04433 115 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 PRKAR1AP10644 381 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ITGA3P26006 1051 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ITPKBP27987 946 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 GPC1P35052 558 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 FEN1P39748 380 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CASRP41180 1078 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 TRPC1P48995 793 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 TMED10P49755 219 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 GPR143P51810 404 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 NRG3P56975 720 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 MEP1AQ16819 746 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 DEFB109BQ30KR1 87 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ZNF628Q5EBL2 1059 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 COQ5Q5HYK3 327 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 FAAH2Q6GMR7 532 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 IGFL3Q6UXB1 125 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 HSDL2Q6YN16 418 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 LANCL3Q6ZV70 420 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ATCAYQ86WG3 371 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.95□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 OR2L13Q8N349 312 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms