RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 NDUFV2P19404 249 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 KRT20P35900 424 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SLC19A1P41440 591 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 P2RX3P56373 397 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CDK6Q00534 326 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SPIBQ01892 262 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 OCA2Q04671 838 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FGL2Q14314 439 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 IRF4Q15306 451 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RFX4Q33E94 735 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 AGBL4Q5VU57 503 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FEVQ99581 238 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DOHHQ9BU89 302 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CHST8Q9H2A9 424 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RLIMQ9NVW2 624 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF11BO00300 401 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SLC16A6O15403 523 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PRKCAP17252 672 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CCNA2P20248 432 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DCKP27707 260 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TTKP33981 857 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SLC9A3P48764 834 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 EPHA4P54764 986 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SELENBP1Q13228 472 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MOGQ16653 247 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 METRNLQ641Q3 311 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FAM129CQ86XR2 697 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 UBE2E3Q969T4 207 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 COX14Q96I36 57 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MYNNQ9NPC7 610 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SCN2AQ99250 2005 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FAM20BO75063 409 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF21O75509 655 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SULT1C4O75897 302 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CPNE6O95741 557 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 C9P02748 559 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SFTPCP11686 197 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CXCR2P25025 360 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PCGF2P35227 344 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PIK3CBP42338 1070 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ITGA1P56199 1179 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 C21orf58P58505 322 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SELENOWP63302 87 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PCDH1Q08174 1060 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 NPRL3Q12980 569 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SGCGQ13326 291 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TP53BP2Q13625 1128 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 NPTX1Q15818 432 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SDE2Q6IQ49 451 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 LCTLQ6UWM7 567 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 AHSA2Q719I0 299 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.63□□□□□ -1.35
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