RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 SLAMF1Q13291 335 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ENPP2Q13822 863 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 DOC2BQ14184 412 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 B3GNT7Q8NFL0 401 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 IL4I1Q96RQ9 567 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ITPAQ9BY32 194 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 C11orf16Q9NQ32 467 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 FTSJ1Q9UET6 329 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 FBXW2Q9UKT8 454 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D3EA0A087X179 549 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PR48 441 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D3LB9A6J9 549 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 M0R3H8 397 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 AIREO43918 545 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ADH1BP00325 375 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D3HP0C7X1 549 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 DBTP11182 482 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 GRK3P35626 688 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP12.15□□□□□ -0.462e-8■□□□□ 8.3
PRAME-213ENST00000492657 CRISP1P54107 249 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 CLDN2P57739 230 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TIGD6Q17RP2 521 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 C18orf63Q68DL7 685 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 DESI1Q6ICB0 168 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 FRMPD2BQ6IN97 320 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 CCDC116Q8IYX3 515 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 STX19Q8N4C7 294 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 MYDGFQ969H8 173 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 SLC38A4Q969I6 547 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 FCRL4Q96PJ5 515 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ROGDIQ9GZN7 287 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 FGF22Q9HCT0 170 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 NEUROD4Q9HD90 331 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 CTPS2Q9NRF8 586 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 FKBP14Q9NWM8 211 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 KCND3Q9UK17 655 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 AP3D1O14617 1153 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 CLEC3AO75596 197 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 S100A1P23297 94 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 RPS21P63220 83 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 CSNK2BP67870 215 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 MADCAM1Q13477 382 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 STEAP3Q658P3 488 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 RD3Q7Z3Z2 195 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 OR2L8Q8NGY9 312 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 C16orf58Q96GQ5 468 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 PSD2Q9BQI7 771 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 PRR14Q9BWN1 585 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 MVB12BQ9H7P6 319 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 CD93Q9NPY3 652 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 SEC14L3Q9UDX4 400 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 KCNE3Q9Y6H6 103 aa12.15□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 POM121BA6NF01 834 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 NR2F1P10589 423 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 KCNJ5P48544 419 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 PPP2CBP62714 309 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 PPP2CAP67775 309 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 RPE65Q16518 533 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 TMEM196Q5HYL7 178 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 LINC00299Q6ZSB3 139 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 PTCHD4Q6ZW05 846 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 DEPDC4Q8N2C3 294 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 RAB42Q8N4Z0 105 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 MS4A6EQ96DS6 147 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 SLC35G5Q96KT7 338 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 BBS4Q96RK4 519 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 APOOQ9BUR5 198 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 HOXD1Q9GZZ0 328 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 PRDM7Q9NQW5 492 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 OSGIN1Q9UJX0 560 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 ZAR1LA6NP61 321 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 OR10H3O60404 316 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
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