RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490127.5

RBM3-209, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 5

Gene RBM3, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-209	ENST00000490127	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127		A0A1W2PS29	197 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	HS6ST1	O60243	411 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	PCDH7	O60245	1069 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	DIAPH2	O60879	1101 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	PDE9A	O76083	593 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	CPM	P14384	443 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	CPA3	P15088	417 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	CHN1	P15882	459 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	ART1	P52961	327 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	NAGLU	P54802	743 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	FOXA1	P55317	472 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	HMGCS1	Q01581	520 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	PCLAF	Q15004	111 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	MPEG1	Q2M385	716 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	SPIN4	Q56A73	249 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	CFAP157	Q5JU67	520 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	CES4A	Q5XG92	561 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	PAOX	Q6QHF9	649 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	OPN5	Q6U736	354 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	MDGA2	Q7Z553	956 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	DOK4	Q8TEW6	326 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	UCK2	Q9BZX2	261 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	RNF6	Q9Y252	685 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	TIMM22	Q9Y584	194 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	ZFHX3	Q15911	3703 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	SERTM1	A2A2V5	107 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	OR6C76	A6NM76	312 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	CRCP	O75575	148 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	TOX	O94900	526 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	CLPS	P04118	112 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	IGFBP2	P18065	325 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	NT5E	P21589	574 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	XK	P51811	444 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	SLC37A1	P57057	533 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	GPR85	P60893	370 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	PMPCA	Q10713	525 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	ASPH	Q12797	758 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	RTL4	Q6ZR62	310 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	ACAD11	Q709F0	780 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	MMP21	Q8N119	569 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	MREG	Q8N565	214 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	BANP	Q8N9N5	519 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	KLHL29	Q96CT2	875 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	APIP	Q96GX9	242 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	PLLP	Q9Y342	182 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	IL3	P08700	152 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	CT62	P0C5K7	136 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	CD99	P14209	185 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	MSX1	P28360	303 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	SSTR4	P31391	388 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	ALDH9A1	P49189	494 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	TFF3	Q07654	80 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-209	ENST00000490127	FUT7	Q11130	342 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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