RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 LPAR4Q99677 370 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 HAUS8Q9BT25 410 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MRI1Q9BV20 369 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 AICDAQ9GZX7 198 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC68Q9H2F9 335 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CDCP1Q9H5V8 836 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 LZTFL1Q9NQ48 299 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 KLHL1Q9NR64 748 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ABCF3Q9NUQ8 709 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM140Q9NV12 185 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKRD10Q9NXR5 420 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TAS2R13Q9NYV9 303 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 LRFN1Q9P244 771 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NPIPA1Q9UND3 350 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 E9PLN8 166 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 GOLGA8MH3BSY2 632 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NDC80O14777 642 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 B3GALT2O43825 422 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NME2P1O60361 137 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC25A12O75746 678 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MLYCDO95822 493 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 UQCRHP07919 91 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC35G6P0C7Q6 338 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ALOX12P18054 663 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 IGFBP2P18065 325 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CAPN3P20807 821 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 IVDP26440 423 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SSTR2P30874 369 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 AHRP35869 848 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 RGS4P49798 205 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 HLCSP50747 726 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CCR8P51685 355 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 AP1S2P56377 157 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 RIPPLY3P57055 190 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 OR4D2P58180 307 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 BTG2P78543 158 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MXRA7P84157 204 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MGAT2Q10469 447 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CRYMQ14894 314 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MFSD4BQ5TF39 518 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NIPAL1Q6NVV3 410 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 GHDCQ8N2G8 530 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 KIF2BQ8N4N8 673 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 APCDD1LQ8NCL9 501 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 C16orf52Q8NHV5 167 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CREB3L4Q8TEY5 395 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 AGAP11Q8TF27 550 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NEIL2Q969S2 332 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PYCR2Q96C36 320 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MS4A14Q96JA4 679 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGED4Q96JG8 741 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PBKQ96KB5 322 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NDNQ99608 321 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 VKORC1Q9BQB6 163 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM167BQ9BTA0 163 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SPNS1Q9H2V7 528 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 IKZF3Q9UKT9 509 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CLDN16Q9Y5I7 305 aa5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SCN2AQ99250 2005 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF860A6NHJ4 632 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SAGE2PA6NJ88 616 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM200CA6NKL6 621 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 C4orf51C9J302 202 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM227AF5H4B4 570 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNHIT1O43257 154 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 OR1F1O43749 312 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 B4GALT2O60909 372 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TTC4O95801 387 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SERPINA6P08185 405 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC175P0C221 793 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PGAM1P18669 254 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 HIST1H2ADP20671 130 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 JAK1P23458 1154 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 FNTAP49354 379 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CYB561P49447 251 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PGGT1BP53609 377 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TAS2R50P59544 299 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 HSF1Q00613 529 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 REEP5Q00765 189 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TFF3Q07654 80 aa5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms