RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488741.5

CREM-238, Transcript of cAMP responsive element modulator, human

TSL 2 BASIC

Gene CREM, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREM-238	ENST00000488741	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ZNF623	O75123	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	TSC22D2	O75157	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CLDN11	O75508	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	GAST	P01350	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	EPHX1	P07099	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	FH	P07954	510 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	RHOC	P08134	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ADRA2A	P08913	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	RRAS	P10301	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	IFI30	P13284	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	DRD2	P14416	443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	NID1	P14543	1247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ATF6	P18850	670 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ZP3	P21754	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	IDS	P22304	550 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	AOAH	P28039	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SLC6A1	P30531	599 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SLC6A4	P31645	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	NSG1	P42857	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CRAT	P43155	626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	RGR	P47804	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SLC11A2	P49281	568 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PGF	P49763	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	XK	P51811	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	AP1S1	P61966	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CDK6	Q00534	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	MXD1	Q05195	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	RAB40B	Q12829	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SNTA1	Q13424	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	TUSC3	Q13454	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	NFATC2	Q13469	925 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	IL18	Q14116	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SEC23B	Q15437	767 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SPIN4	Q56A73	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	DCST1	Q5T197	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	NAGS	Q8N159	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ASB8	Q9H765	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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